Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01547P58512 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01547P58512 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01547P58512 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01547P58512 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC01547P58512 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01547P58512 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01547P58512 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01547P58512 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms