Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PMS2P54278 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PMS2P54278 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PMS2P54278 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PMS2P54278 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PMS2P54278 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PMS2P54278 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PMS2P54278 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PMS2P54278 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PMS2P54278 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PMS2P54278 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PMS2P54278 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PMS2P54278 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PMS2P54278 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PMS2P54278 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PMS2P54278 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PMS2P54278 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PMS2P54278 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PMS2P54278 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PMS2P54278 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PMS2P54278 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PMS2P54278 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PMS2P54278 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PMS2P54278 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PMS2P54278 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PMS2P54278 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PMS2P54278 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PMS2P54278 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PMS2P54278 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PMS2P54278 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PMS2P54278 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PMS2P54278 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PMS2P54278 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PMS2P54278 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PMS2P54278 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PMS2P54278 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PMS2P54278 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PMS2P54278 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PMS2P54278 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PMS2P54278 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PMS2P54278 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PMS2P54278 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PMS2P54278 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PMS2P54278 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMS2P54278 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMS2P54278 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PMS2P54278 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMS2P54278 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PMS2P54278 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PMS2P54278 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PMS2P54278 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PMS2P54278 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PMS2P54278 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PMS2P54278 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PMS2P54278 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PMS2P54278 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PMS2P54278 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PMS2P54278 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PMS2P54278 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PMS2P54278 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PMS2P54278 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PMS2P54278 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMS2P54278 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMS2P54278 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMS2P54278 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PMS2P54278 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PMS2P54278 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PMS2P54278 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PMS2P54278 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PMS2P54278 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PMS2P54278 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PMS2P54278 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PMS2P54278 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PMS2P54278 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PMS2P54278 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMS2P54278 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PMS2P54278 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PMS2P54278 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PMS2P54278 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMS2P54278 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PMS2P54278 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMS2P54278 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMS2P54278 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PMS2P54278 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PMS2P54278 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMS2P54278 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMS2P54278 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PMS2P54278 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PMS2P54278 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PMS2P54278 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS2P54278 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PMS2P54278 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PMS2P54278 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PMS2P54278 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS2P54278 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PMS2P54278 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PMS2P54278 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMS2P54278 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS2P54278 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMS2P54278 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms