Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MECP2P51608 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MECP2P51608 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MECP2P51608 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MECP2P51608 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MECP2P51608 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MECP2P51608 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MECP2P51608 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MECP2P51608 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MECP2P51608 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MECP2P51608 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MECP2P51608 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MECP2P51608 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MECP2P51608 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MECP2P51608 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MECP2P51608 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MECP2P51608 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MECP2P51608 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MECP2P51608 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MECP2P51608 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MECP2P51608 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MECP2P51608 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MECP2P51608 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MECP2P51608 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MECP2P51608 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MECP2P51608 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MECP2P51608 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MECP2P51608 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MECP2P51608 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MECP2P51608 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MECP2P51608 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MECP2P51608 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MECP2P51608 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MECP2P51608 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MECP2P51608 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MECP2P51608 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MECP2P51608 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MECP2P51608 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MECP2P51608 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MECP2P51608 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MECP2P51608 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MECP2P51608 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MECP2P51608 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MECP2P51608 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MECP2P51608 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MECP2P51608 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MECP2P51608 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MECP2P51608 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MECP2P51608 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MECP2P51608 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MECP2P51608 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MECP2P51608 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MECP2P51608 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MECP2P51608 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MECP2P51608 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MECP2P51608 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MECP2P51608 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MECP2P51608 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MECP2P51608 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MECP2P51608 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MECP2P51608 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MECP2P51608 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MECP2P51608 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MECP2P51608 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MECP2P51608 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MECP2P51608 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MECP2P51608 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MECP2P51608 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MECP2P51608 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MECP2P51608 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MECP2P51608 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MECP2P51608 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MECP2P51608 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MECP2P51608 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MECP2P51608 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MECP2P51608 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MECP2P51608 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MECP2P51608 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MECP2P51608 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MECP2P51608 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MECP2P51608 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MECP2P51608 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MECP2P51608 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MECP2P51608 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MECP2P51608 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MECP2P51608 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MECP2P51608 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MECP2P51608 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MECP2P51608 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MECP2P51608 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MECP2P51608 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MECP2P51608 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MECP2P51608 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MECP2P51608 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MECP2P51608 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MECP2P51608 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MECP2P51608 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MECP2P51608 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MECP2P51608 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MECP2P51608 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms