Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB5CP51148 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB5CP51148 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB5CP51148 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB5CP51148 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB5CP51148 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB5CP51148 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB5CP51148 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB5CP51148 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB5CP51148 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB5CP51148 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB5CP51148 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB5CP51148 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB5CP51148 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB5CP51148 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms