Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAPOLAP51003 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAPOLAP51003 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAPOLAP51003 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAPOLAP51003 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PAPOLAP51003 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAPOLAP51003 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAPOLAP51003 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PAPOLAP51003 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAPOLAP51003 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAPOLAP51003 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAPOLAP51003 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAPOLAP51003 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAPOLAP51003 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAPOLAP51003 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PAPOLAP51003 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PAPOLAP51003 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PAPOLAP51003 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPOLAP51003 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPOLAP51003 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PAPOLAP51003 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAPOLAP51003 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms