Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF144AP50876 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF144AP50876 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF144AP50876 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF144AP50876 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF144AP50876 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF144AP50876 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF144AP50876 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF144AP50876 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF144AP50876 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF144AP50876 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF144AP50876 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF144AP50876 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF144AP50876 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF144AP50876 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms