Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSC2P49815 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSC2P49815 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSC2P49815 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSC2P49815 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TSC2P49815 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSC2P49815 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSC2P49815 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSC2P49815 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TSC2P49815 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TSC2P49815 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TSC2P49815 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSC2P49815 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSC2P49815 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSC2P49815 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TSC2P49815 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSC2P49815 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSC2P49815 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TSC2P49815 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSC2P49815 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSC2P49815 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSC2P49815 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TSC2P49815 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSC2P49815 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TSC2P49815 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TSC2P49815 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSC2P49815 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSC2P49815 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSC2P49815 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSC2P49815 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSC2P49815 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSC2P49815 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSC2P49815 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TSC2P49815 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TSC2P49815 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSC2P49815 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSC2P49815 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TSC2P49815 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TSC2P49815 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSC2P49815 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TSC2P49815 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSC2P49815 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TSC2P49815 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSC2P49815 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TSC2P49815 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSC2P49815 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSC2P49815 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSC2P49815 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSC2P49815 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSC2P49815 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TSC2P49815 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSC2P49815 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TSC2P49815 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSC2P49815 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TSC2P49815 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSC2P49815 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSC2P49815 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TSC2P49815 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TSC2P49815 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TSC2P49815 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSC2P49815 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSC2P49815 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TSC2P49815 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSC2P49815 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSC2P49815 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSC2P49815 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSC2P49815 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSC2P49815 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSC2P49815 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSC2P49815 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSC2P49815 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSC2P49815 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TSC2P49815 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSC2P49815 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSC2P49815 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TSC2P49815 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSC2P49815 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSC2P49815 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSC2P49815 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSC2P49815 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSC2P49815 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSC2P49815 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSC2P49815 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TSC2P49815 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSC2P49815 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSC2P49815 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSC2P49815 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSC2P49815 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TSC2P49815 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TSC2P49815 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TSC2P49815 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TSC2P49815 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC2P49815 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSC2P49815 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSC2P49815 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSC2P49815 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TSC2P49815 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSC2P49815 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TSC2P49815 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TSC2P49815 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms