Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC34P49427 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC34P49427 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC34P49427 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC34P49427 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC34P49427 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC34P49427 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC34P49427 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC34P49427 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC34P49427 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC34P49427 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC34P49427 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC34P49427 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDC34P49427 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC34P49427 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC34P49427 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC34P49427 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC34P49427 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC34P49427 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC34P49427 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC34P49427 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC34P49427 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC34P49427 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC34P49427 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC34P49427 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC34P49427 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC34P49427 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC34P49427 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC34P49427 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC34P49427 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC34P49427 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC34P49427 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC34P49427 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC34P49427 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC34P49427 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC34P49427 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC34P49427 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC34P49427 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC34P49427 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC34P49427 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC34P49427 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC34P49427 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC34P49427 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC34P49427 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC34P49427 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC34P49427 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC34P49427 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC34P49427 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC34P49427 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC34P49427 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC34P49427 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC34P49427 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC34P49427 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC34P49427 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC34P49427 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC34P49427 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC34P49427 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC34P49427 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC34P49427 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC34P49427 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC34P49427 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC34P49427 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC34P49427 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC34P49427 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC34P49427 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC34P49427 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC34P49427 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC34P49427 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC34P49427 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC34P49427 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC34P49427 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC34P49427 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC34P49427 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC34P49427 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC34P49427 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC34P49427 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC34P49427 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC34P49427 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC34P49427 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC34P49427 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC34P49427 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC34P49427 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC34P49427 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC34P49427 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC34P49427 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC34P49427 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC34P49427 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC34P49427 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC34P49427 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC34P49427 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC34P49427 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC34P49427 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC34P49427 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC34P49427 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC34P49427 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC34P49427 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC34P49427 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDC34P49427 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC34P49427 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC34P49427 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms