Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC1P41238 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC1P41238 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC1P41238 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC1P41238 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC1P41238 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC1P41238 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC1P41238 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC1P41238 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC1P41238 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC1P41238 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC1P41238 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC1P41238 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC1P41238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC1P41238 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC1P41238 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC1P41238 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC1P41238 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC1P41238 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC1P41238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC1P41238 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC1P41238 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms