Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIPAP38571 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIPAP38571 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIPAP38571 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIPAP38571 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIPAP38571 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LIPAP38571 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIPAP38571 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIPAP38571 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIPAP38571 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LIPAP38571 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIPAP38571 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIPAP38571 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIPAP38571 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIPAP38571 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIPAP38571 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIPAP38571 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIPAP38571 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIPAP38571 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIPAP38571 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIPAP38571 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIPAP38571 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIPAP38571 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIPAP38571 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIPAP38571 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LIPAP38571 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIPAP38571 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIPAP38571 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIPAP38571 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPAP38571 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPAP38571 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPAP38571 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIPAP38571 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIPAP38571 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPAP38571 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPAP38571 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPAP38571 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPAP38571 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIPAP38571 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIPAP38571 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIPAP38571 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIPAP38571 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIPAP38571 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIPAP38571 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPAP38571 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPAP38571 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPAP38571 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIPAP38571 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIPAP38571 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPAP38571 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPAP38571 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPAP38571 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIPAP38571 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPAP38571 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIPAP38571 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIPAP38571 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIPAP38571 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIPAP38571 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIPAP38571 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIPAP38571 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIPAP38571 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LIPAP38571 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIPAP38571 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIPAP38571 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIPAP38571 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIPAP38571 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIPAP38571 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIPAP38571 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIPAP38571 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIPAP38571 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIPAP38571 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIPAP38571 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIPAP38571 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIPAP38571 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIPAP38571 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LIPAP38571 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIPAP38571 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIPAP38571 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIPAP38571 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIPAP38571 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIPAP38571 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LIPAP38571 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIPAP38571 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIPAP38571 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIPAP38571 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIPAP38571 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIPAP38571 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIPAP38571 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LIPAP38571 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIPAP38571 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIPAP38571 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIPAP38571 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIPAP38571 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIPAP38571 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIPAP38571 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIPAP38571 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIPAP38571 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LIPAP38571 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIPAP38571 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LIPAP38571 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 591.5 ms