Protein–RNA interactions for Protein: P37173

TGFBR2, TGF-beta receptor type-2, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR2P37173 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFBR2P37173 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGFBR2P37173 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGFBR2P37173 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGFBR2P37173 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGFBR2P37173 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGFBR2P37173 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGFBR2P37173 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGFBR2P37173 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TGFBR2P37173 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TGFBR2P37173 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGFBR2P37173 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGFBR2P37173 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGFBR2P37173 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGFBR2P37173 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TGFBR2P37173 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFBR2P37173 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFBR2P37173 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFBR2P37173 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TGFBR2P37173 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TGFBR2P37173 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TGFBR2P37173 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms