Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RDXP35241 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RDXP35241 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RDXP35241 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RDXP35241 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RDXP35241 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RDXP35241 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RDXP35241 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RDXP35241 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RDXP35241 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RDXP35241 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RDXP35241 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RDXP35241 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RDXP35241 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RDXP35241 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RDXP35241 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RDXP35241 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RDXP35241 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RDXP35241 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RDXP35241 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RDXP35241 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RDXP35241 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RDXP35241 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RDXP35241 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RDXP35241 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RDXP35241 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RDXP35241 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RDXP35241 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RDXP35241 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RDXP35241 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RDXP35241 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RDXP35241 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RDXP35241 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RDXP35241 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RDXP35241 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RDXP35241 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RDXP35241 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RDXP35241 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RDXP35241 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RDXP35241 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RDXP35241 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RDXP35241 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RDXP35241 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RDXP35241 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RDXP35241 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RDXP35241 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RDXP35241 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RDXP35241 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RDXP35241 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RDXP35241 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RDXP35241 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RDXP35241 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RDXP35241 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RDXP35241 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDXP35241 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDXP35241 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDXP35241 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RDXP35241 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RDXP35241 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RDXP35241 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RDXP35241 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RDXP35241 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RDXP35241 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RDXP35241 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RDXP35241 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RDXP35241 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RDXP35241 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RDXP35241 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RDXP35241 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RDXP35241 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RDXP35241 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RDXP35241 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RDXP35241 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RDXP35241 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDXP35241 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDXP35241 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDXP35241 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDXP35241 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDXP35241 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RDXP35241 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RDXP35241 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RDXP35241 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RDXP35241 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDXP35241 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDXP35241 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDXP35241 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDXP35241 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RDXP35241 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RDXP35241 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RDXP35241 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RDXP35241 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RDXP35241 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RDXP35241 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RDXP35241 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RDXP35241 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RDXP35241 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RDXP35241 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RDXP35241 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RDXP35241 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RDXP35241 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms