Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERP29P30040 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP29P30040 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERP29P30040 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP29P30040 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP29P30040 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERP29P30040 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP29P30040 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP29P30040 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERP29P30040 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERP29P30040 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP29P30040 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP29P30040 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP29P30040 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERP29P30040 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERP29P30040 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP29P30040 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERP29P30040 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP29P30040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERP29P30040 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP29P30040 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP29P30040 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERP29P30040 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERP29P30040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERP29P30040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERP29P30040 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERP29P30040 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERP29P30040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP29P30040 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP29P30040 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERP29P30040 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERP29P30040 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERP29P30040 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERP29P30040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERP29P30040 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERP29P30040 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP29P30040 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERP29P30040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERP29P30040 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP29P30040 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERP29P30040 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERP29P30040 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERP29P30040 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERP29P30040 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERP29P30040 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERP29P30040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERP29P30040 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERP29P30040 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERP29P30040 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERP29P30040 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERP29P30040 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERP29P30040 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERP29P30040 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERP29P30040 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERP29P30040 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERP29P30040 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERP29P30040 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERP29P30040 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERP29P30040 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERP29P30040 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERP29P30040 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERP29P30040 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERP29P30040 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERP29P30040 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERP29P30040 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERP29P30040 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERP29P30040 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERP29P30040 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERP29P30040 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERP29P30040 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERP29P30040 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERP29P30040 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERP29P30040 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERP29P30040 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERP29P30040 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERP29P30040 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERP29P30040 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERP29P30040 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERP29P30040 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERP29P30040 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP29P30040 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP29P30040 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERP29P30040 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERP29P30040 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERP29P30040 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP29P30040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP29P30040 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERP29P30040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP29P30040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP29P30040 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP29P30040 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP29P30040 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP29P30040 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERP29P30040 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERP29P30040 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ERP29P30040 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERP29P30040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP29P30040 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERP29P30040 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERP29P30040 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms