Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMA1P25786 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMA1P25786 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSMA1P25786 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMA1P25786 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMA1P25786 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMA1P25786 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMA1P25786 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMA1P25786 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMA1P25786 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMA1P25786 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMA1P25786 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA1P25786 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA1P25786 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA1P25786 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA1P25786 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA1P25786 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms