Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ACTN1P12814 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ACTN1P12814 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ACTN1P12814 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ACTN1P12814 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ACTN1P12814 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ACTN1P12814 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ACTN1P12814 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ACTN1P12814 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ACTN1P12814 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ACTN1P12814 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ACTN1P12814 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ACTN1P12814 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ACTN1P12814 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ACTN1P12814 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ACTN1P12814 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ACTN1P12814 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ACTN1P12814 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ACTN1P12814 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ACTN1P12814 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ACTN1P12814 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ACTN1P12814 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ACTN1P12814 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACTN1P12814 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms