Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ACTN1P12814 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ACTN1P12814 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ACTN1P12814 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ACTN1P12814 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ACTN1P12814 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ACTN1P12814 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACTN1P12814 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ACTN1P12814 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ACTN1P12814 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ACTN1P12814 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ACTN1P12814 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ACTN1P12814 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ACTN1P12814 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
ACTN1P12814 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ACTN1P12814 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ACTN1P12814 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ACTN1P12814 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ACTN1P12814 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ACTN1P12814 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ACTN1P12814 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ACTN1P12814 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACTN1P12814 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ACTN1P12814 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ACTN1P12814 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ACTN1P12814 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ACTN1P12814 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ACTN1P12814 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ACTN1P12814 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ACTN1P12814 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ACTN1P12814 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ACTN1P12814 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ACTN1P12814 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ACTN1P12814 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ACTN1P12814 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ACTN1P12814 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ACTN1P12814 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ACTN1P12814 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ACTN1P12814 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ACTN1P12814 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ACTN1P12814 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ACTN1P12814 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ACTN1P12814 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ACTN1P12814 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ACTN1P12814 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ACTN1P12814 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ACTN1P12814 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ACTN1P12814 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ACTN1P12814 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ACTN1P12814 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ACTN1P12814 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ACTN1P12814 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ACTN1P12814 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ACTN1P12814 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ACTN1P12814 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ACTN1P12814 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ACTN1P12814 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ACTN1P12814 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ACTN1P12814 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ACTN1P12814 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ACTN1P12814 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ACTN1P12814 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ACTN1P12814 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ACTN1P12814 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ACTN1P12814 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ACTN1P12814 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ACTN1P12814 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ACTN1P12814 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ACTN1P12814 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACTN1P12814 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ACTN1P12814 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACTN1P12814 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACTN1P12814 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ACTN1P12814 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ACTN1P12814 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ACTN1P12814 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ACTN1P12814 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ACTN1P12814 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ACTN1P12814 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
ACTN1P12814 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ACTN1P12814 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ACTN1P12814 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ACTN1P12814 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ACTN1P12814 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ACTN1P12814 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ACTN1P12814 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ACTN1P12814 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ACTN1P12814 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ACTN1P12814 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ACTN1P12814 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ACTN1P12814 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ACTN1P12814 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ACTN1P12814 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ACTN1P12814 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ACTN1P12814 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ACTN1P12814 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ACTN1P12814 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ACTN1P12814 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ACTN1P12814 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ACTN1P12814 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms