Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINGO3P0C6S8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINGO3P0C6S8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINGO3P0C6S8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINGO3P0C6S8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINGO3P0C6S8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LINGO3P0C6S8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LINGO3P0C6S8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO3P0C6S8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO3P0C6S8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO3P0C6S8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LINGO3P0C6S8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINGO3P0C6S8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINGO3P0C6S8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINGO3P0C6S8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINGO3P0C6S8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINGO3P0C6S8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINGO3P0C6S8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINGO3P0C6S8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINGO3P0C6S8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINGO3P0C6S8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LINGO3P0C6S8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINGO3P0C6S8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINGO3P0C6S8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINGO3P0C6S8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINGO3P0C6S8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms