Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRM2P04554 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRM2P04554 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRM2P04554 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRM2P04554 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRM2P04554 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM2P04554 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM2P04554 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM2P04554 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRM2P04554 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM2P04554 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRM2P04554 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRM2P04554 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM2P04554 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRM2P04554 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRM2P04554 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRM2P04554 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRM2P04554 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRM2P04554 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRM2P04554 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRM2P04554 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRM2P04554 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRM2P04554 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRM2P04554 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRM2P04554 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRM2P04554 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRM2P04554 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRM2P04554 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRM2P04554 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRM2P04554 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRM2P04554 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRM2P04554 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRM2P04554 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRM2P04554 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRM2P04554 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRM2P04554 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRM2P04554 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRM2P04554 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM2P04554 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM2P04554 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRM2P04554 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM2P04554 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM2P04554 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRM2P04554 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM2P04554 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRM2P04554 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM2P04554 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRM2P04554 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM2P04554 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM2P04554 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM2P04554 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRM2P04554 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRM2P04554 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM2P04554 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM2P04554 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRM2P04554 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRM2P04554 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRM2P04554 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PRM2P04554 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRM2P04554 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRM2P04554 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRM2P04554 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRM2P04554 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRM2P04554 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRM2P04554 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRM2P04554 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PRM2P04554 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRM2P04554 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRM2P04554 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRM2P04554 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PRM2P04554 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRM2P04554 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRM2P04554 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRM2P04554 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRM2P04554 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRM2P04554 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRM2P04554 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRM2P04554 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRM2P04554 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRM2P04554 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRM2P04554 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRM2P04554 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRM2P04554 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRM2P04554 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRM2P04554 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRM2P04554 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRM2P04554 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRM2P04554 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRM2P04554 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRM2P04554 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PRM2P04554 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRM2P04554 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PRM2P04554 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRM2P04554 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRM2P04554 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRM2P04554 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRM2P04554 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRM2P04554 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRM2P04554 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRM2P04554 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms