Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRM2P04554 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRM2P04554 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRM2P04554 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRM2P04554 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRM2P04554 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRM2P04554 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRM2P04554 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRM2P04554 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRM2P04554 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM2P04554 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM2P04554 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM2P04554 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM2P04554 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRM2P04554 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRM2P04554 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRM2P04554 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRM2P04554 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRM2P04554 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRM2P04554 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRM2P04554 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM2P04554 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRM2P04554 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM2P04554 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRM2P04554 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRM2P04554 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRM2P04554 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRM2P04554 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRM2P04554 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRM2P04554 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRM2P04554 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRM2P04554 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRM2P04554 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM2P04554 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRM2P04554 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRM2P04554 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRM2P04554 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRM2P04554 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM2P04554 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRM2P04554 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRM2P04554 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRM2P04554 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM2P04554 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM2P04554 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRM2P04554 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRM2P04554 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRM2P04554 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRM2P04554 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRM2P04554 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRM2P04554 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRM2P04554 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRM2P04554 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRM2P04554 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRM2P04554 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRM2P04554 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRM2P04554 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRM2P04554 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRM2P04554 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRM2P04554 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRM2P04554 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRM2P04554 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRM2P04554 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRM2P04554 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRM2P04554 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRM2P04554 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRM2P04554 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRM2P04554 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRM2P04554 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRM2P04554 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRM2P04554 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRM2P04554 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRM2P04554 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRM2P04554 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRM2P04554 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRM2P04554 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRM2P04554 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRM2P04554 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRM2P04554 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRM2P04554 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRM2P04554 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRM2P04554 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRM2P04554 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM2P04554 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRM2P04554 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRM2P04554 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM2P04554 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRM2P04554 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRM2P04554 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRM2P04554 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRM2P04554 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRM2P04554 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRM2P04554 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM2P04554 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM2P04554 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRM2P04554 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRM2P04554 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRM2P04554 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRM2P04554 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRM2P04554 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRM2P04554 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms