Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHV3-11P01762 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV3-11P01762 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV3-11P01762 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV3-11P01762 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-11P01762 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHV3-11P01762 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGHV3-11P01762 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IGHV3-11P01762 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGHV3-11P01762 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms