Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MT-CO1P00395 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MT-CO1P00395 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MT-CO1P00395 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MT-CO1P00395 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MT-CO1P00395 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MT-CO1P00395 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MT-CO1P00395 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MT-CO1P00395 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MT-CO1P00395 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MT-CO1P00395 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MT-CO1P00395 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MT-CO1P00395 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MT-CO1P00395 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MT-CO1P00395 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MT-CO1P00395 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MT-CO1P00395 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MT-CO1P00395 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MT-CO1P00395 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 769 ms