Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUDT3O95989 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUDT3O95989 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUDT3O95989 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUDT3O95989 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDT3O95989 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NUDT3O95989 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUDT3O95989 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUDT3O95989 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms