Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
WDR47O94967 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
WDR47O94967 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR47O94967 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
WDR47O94967 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
WDR47O94967 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR47O94967 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR47O94967 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR47O94967 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR47O94967 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR47O94967 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR47O94967 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR47O94967 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR47O94967 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR47O94967 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR47O94967 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR47O94967 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR47O94967 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR47O94967 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR47O94967 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR47O94967 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR47O94967 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR47O94967 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR47O94967 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR47O94967 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR47O94967 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR47O94967 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR47O94967 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR47O94967 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR47O94967 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR47O94967 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR47O94967 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR47O94967 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR47O94967 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR47O94967 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR47O94967 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR47O94967 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR47O94967 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR47O94967 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR47O94967 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR47O94967 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR47O94967 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR47O94967 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR47O94967 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
WDR47O94967 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR47O94967 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR47O94967 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR47O94967 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR47O94967 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR47O94967 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR47O94967 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR47O94967 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR47O94967 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR47O94967 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR47O94967 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR47O94967 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR47O94967 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR47O94967 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR47O94967 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR47O94967 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR47O94967 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR47O94967 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR47O94967 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR47O94967 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR47O94967 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR47O94967 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR47O94967 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR47O94967 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR47O94967 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR47O94967 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR47O94967 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR47O94967 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR47O94967 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR47O94967 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR47O94967 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR47O94967 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR47O94967 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR47O94967 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR47O94967 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR47O94967 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR47O94967 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR47O94967 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR47O94967 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR47O94967 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR47O94967 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR47O94967 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR47O94967 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR47O94967 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR47O94967 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR47O94967 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR47O94967 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR47O94967 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR47O94967 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR47O94967 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR47O94967 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR47O94967 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR47O94967 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR47O94967 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR47O94967 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR47O94967 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms