Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT33AO76009 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT33AO76009 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT33AO76009 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT33AO76009 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT33AO76009 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT33AO76009 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT33AO76009 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT33AO76009 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT33AO76009 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT33AO76009 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT33AO76009 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT33AO76009 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT33AO76009 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT33AO76009 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT33AO76009 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms