Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC28A2O43868 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC28A2O43868 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC28A2O43868 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A2O43868 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC28A2O43868 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC28A2O43868 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC28A2O43868 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC28A2O43868 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC28A2O43868 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC28A2O43868 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC28A2O43868 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC28A2O43868 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC28A2O43868 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC28A2O43868 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms