Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARPC1BO15143 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARPC1BO15143 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARPC1BO15143 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARPC1BO15143 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARPC1BO15143 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARPC1BO15143 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARPC1BO15143 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARPC1BO15143 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARPC1BO15143 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARPC1BO15143 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARPC1BO15143 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARPC1BO15143 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARPC1BO15143 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC1BO15143 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC1BO15143 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms