Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AGPSO00116 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AGPSO00116 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AGPSO00116 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AGPSO00116 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AGPSO00116 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AGPSO00116 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AGPSO00116 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AGPSO00116 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AGPSO00116 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AGPSO00116 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AGPSO00116 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AGPSO00116 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AGPSO00116 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AGPSO00116 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AGPSO00116 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AGPSO00116 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AGPSO00116 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AGPSO00116 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGPSO00116 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGPSO00116 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGPSO00116 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGPSO00116 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AGPSO00116 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AGPSO00116 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AGPSO00116 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AGPSO00116 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AGPSO00116 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGPSO00116 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGPSO00116 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGPSO00116 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AGPSO00116 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AGPSO00116 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AGPSO00116 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AGPSO00116 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AGPSO00116 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AGPSO00116 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AGPSO00116 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AGPSO00116 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGPSO00116 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGPSO00116 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGPSO00116 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGPSO00116 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AGPSO00116 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGPSO00116 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGPSO00116 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGPSO00116 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGPSO00116 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGPSO00116 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGPSO00116 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGPSO00116 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGPSO00116 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGPSO00116 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGPSO00116 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
AGPSO00116 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGPSO00116 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGPSO00116 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGPSO00116 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGPSO00116 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGPSO00116 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGPSO00116 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGPSO00116 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
AGPSO00116 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AGPSO00116 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AGPSO00116 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
AGPSO00116 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AGPSO00116 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AGPSO00116 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AGPSO00116 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AGPSO00116 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AGPSO00116 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AGPSO00116 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AGPSO00116 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGPSO00116 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGPSO00116 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGPSO00116 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGPSO00116 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AGPSO00116 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AGPSO00116 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGPSO00116 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AGPSO00116 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AGPSO00116 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AGPSO00116 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGPSO00116 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGPSO00116 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGPSO00116 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGPSO00116 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGPSO00116 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGPSO00116 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGPSO00116 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGPSO00116 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGPSO00116 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AGPSO00116 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGPSO00116 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGPSO00116 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGPSO00116 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGPSO00116 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGPSO00116 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGPSO00116 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGPSO00116 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms