Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPB11E5RHQ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB11E5RHQ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPB11E5RHQ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB11E5RHQ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPB11E5RHQ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPIPB11E5RHQ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPIPB11E5RHQ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB11E5RHQ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB11E5RHQ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB11E5RHQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPIPB11E5RHQ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPIPB11E5RHQ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms