Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRM3A6NNA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRRM3A6NNA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SRRM3A6NNA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRM3A6NNA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRM3A6NNA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRM3A6NNA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRM3A6NNA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRRM3A6NNA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRRM3A6NNA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRRM3A6NNA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRRM3A6NNA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRRM3A6NNA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRRM3A6NNA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRRM3A6NNA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRRM3A6NNA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRM3A6NNA2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRM3A6NNA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms