Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM72A0PK05 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM72A0PK05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM72A0PK05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM72A0PK05 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM72A0PK05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM72A0PK05 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM72A0PK05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM72A0PK05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM72A0PK05 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM72A0PK05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM72A0PK05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM72A0PK05 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM72A0PK05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM72A0PK05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM72A0PK05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM72A0PK05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM72A0PK05 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM72A0PK05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM72A0PK05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM72A0PK05 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM72A0PK05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM72A0PK05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM72A0PK05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM72A0PK05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM72A0PK05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms