Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX35

IGHV3-64D, Immunoglobulin heavy variable 3-64D, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms