Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE3Q969Y0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE3Q969Y0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms