RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482052.5

HLA-L-211, Transcript of major histocompatibility complex, class I, L (pseudogene), humanhuman

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Gene HLA-L, Length 1,765 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-L-211ENST00000482052 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.11■■■■■ 6.09
HLA-L-211ENST00000482052 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.32■■■■■ 5.01
HLA-L-211ENST00000482052 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
HLA-L-211ENST00000482052 ABCC9O60706 1549 aa44.09■■■■■ 4.65
HLA-L-211ENST00000482052 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.03■■■■■ 4.64
HLA-L-211ENST00000482052 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.88■■■■■ 4.61
HLA-L-211ENST00000482052 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.42■■■■■ 4.54
HLA-L-211ENST00000482052 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.28■■■■■ 4.52
HLA-L-211ENST00000482052 NACADO15069 1562 aa43.23■■■■■ 4.51
HLA-L-211ENST00000482052 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.91■■■■■ 4.46
HLA-L-211ENST00000482052 SCRIBQ14160 1630 aa42.66■■■■■ 4.42
HLA-L-211ENST00000482052 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.99■■■■■ 4.31
HLA-L-211ENST00000482052 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.65■■■■■ 4.26
HLA-L-211ENST00000482052 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
HLA-L-211ENST00000482052 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
HLA-L-211ENST00000482052 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.33■■■■■ 4.21
HLA-L-211ENST00000482052 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
HLA-L-211ENST00000482052 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.05■■■■■ 4.16
HLA-L-211ENST00000482052 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
HLA-L-211ENST00000482052 SMARCA4P51532 1647 aa40.85■■■■■ 4.13
HLA-L-211ENST00000482052 WIZO95785 1651 aa40.69■■■■■ 4.1
HLA-L-211ENST00000482052 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
HLA-L-211ENST00000482052 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.34■■■■■ 4.05
HLA-L-211ENST00000482052 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.27■■■■■ 4.04
HLA-L-211ENST00000482052 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
HLA-L-211ENST00000482052 SMARCA2P51531 1590 aa40.19■■■■■ 4.02
HLA-L-211ENST00000482052 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
HLA-L-211ENST00000482052 NCAPD3P42695 1498 aa39.94■■■■□ 3.98
HLA-L-211ENST00000482052 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.88■■■■□ 3.97
HLA-L-211ENST00000482052 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.86■■■■□ 3.97
HLA-L-211ENST00000482052 HMGXB3Q12766 1538 aa39.83■■■■□ 3.97
HLA-L-211ENST00000482052 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.65■■■■□ 3.94
HLA-L-211ENST00000482052 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.11■■■■□ 3.85
HLA-L-211ENST00000482052 TRIM41Q8WV44 630 aa39.06■■■■□ 3.84
HLA-L-211ENST00000482052 CFTRP13569 1480 aa39.01■■■■□ 3.83
HLA-L-211ENST00000482052 ABCC8Q09428 1581 aa38.97■■■■□ 3.83
HLA-L-211ENST00000482052 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.93■■■■□ 3.82
HLA-L-211ENST00000482052 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
HLA-L-211ENST00000482052 PRDM2Q13029 1718 aa38.67■■■■□ 3.78
HLA-L-211ENST00000482052 NESP48681 1621 aa38.66■■■■□ 3.78
HLA-L-211ENST00000482052 SYNJ1O43426 1573 aa38.58■■■■□ 3.77
HLA-L-211ENST00000482052 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.58■■■■□ 3.77
HLA-L-211ENST00000482052 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.48■■■■□ 3.75
HLA-L-211ENST00000482052 TOP2BQ02880 1626 aa38.41■■■■□ 3.74
HLA-L-211ENST00000482052 CUX1P39880 1505 aa38.39■■■■□ 3.74
HLA-L-211ENST00000482052 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
HLA-L-211ENST00000482052 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.35■■■■□ 3.73
HLA-L-211ENST00000482052 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.32■■■■□ 3.73
HLA-L-211ENST00000482052 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.25■■■■□ 3.71
HLA-L-211ENST00000482052 SOGA1O94964 1423 aa38.23■■■■□ 3.71
HLA-L-211ENST00000482052 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.16■■■■□ 3.7
HLA-L-211ENST00000482052 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.12■■■■□ 3.69
HLA-L-211ENST00000482052 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.11■■■■□ 3.69
HLA-L-211ENST00000482052 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.08■■■■□ 3.69
HLA-L-211ENST00000482052 EEA1Q15075 1411 aa38.05■■■■□ 3.68
HLA-L-211ENST00000482052 TOPBP1Q92547 1522 aa38.04■■■■□ 3.68
HLA-L-211ENST00000482052 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
HLA-L-211ENST00000482052 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.01■■■■□ 3.67
HLA-L-211ENST00000482052 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.93■■■■□ 3.66
HLA-L-211ENST00000482052 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.88■■■■□ 3.65
HLA-L-211ENST00000482052 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
HLA-L-211ENST00000482052 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.84■■■■□ 3.65
HLA-L-211ENST00000482052 ERCC6Q03468 1493 aa37.81■■■■□ 3.64
HLA-L-211ENST00000482052 KIF27Q86VH2 1401 aa37.78■■■■□ 3.64
HLA-L-211ENST00000482052 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.76■■■■□ 3.63
HLA-L-211ENST00000482052 CUX2O14529 1486 aa37.73■■■■□ 3.63
HLA-L-211ENST00000482052 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.65■■■■□ 3.62
HLA-L-211ENST00000482052 WDR62O43379 1518 aa37.64■■■■□ 3.62
HLA-L-211ENST00000482052 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
HLA-L-211ENST00000482052 KIF21BO75037 1637 aa37.55■■■■□ 3.6
HLA-L-211ENST00000482052 GOLGA3Q08378 1498 aa37.54■■■■□ 3.6
HLA-L-211ENST00000482052 WDR97A6NE52 1622 aa37.49■■■■□ 3.59
HLA-L-211ENST00000482052 IGF1RP08069 1367 aa37.49■■■■□ 3.59
HLA-L-211ENST00000482052 PRXQ9BXM0 1461 aa37.47■■■■□ 3.59
HLA-L-211ENST00000482052 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
HLA-L-211ENST00000482052 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.45■■■■□ 3.59
HLA-L-211ENST00000482052 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
HLA-L-211ENST00000482052 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.41■■■■□ 3.58
HLA-L-211ENST00000482052 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.39■■■■□ 3.58
HLA-L-211ENST00000482052 IFT140Q96RY7 1462 aa37.35■■■■□ 3.57
HLA-L-211ENST00000482052 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.34■■■■□ 3.57
HLA-L-211ENST00000482052 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.33■■■■□ 3.57
HLA-L-211ENST00000482052 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.3■■■■□ 3.56
HLA-L-211ENST00000482052 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
HLA-L-211ENST00000482052 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.21■■■■□ 3.55
HLA-L-211ENST00000482052 CEP162Q5TB80 1403 aa37.19■■■■□ 3.54
HLA-L-211ENST00000482052 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
HLA-L-211ENST00000482052 CUL7Q14999 1698 aa37.13■■■■□ 3.53
HLA-L-211ENST00000482052 PBRM1Q86U86 1689 aa37.04■■■■□ 3.52
HLA-L-211ENST00000482052 GRIN2BQ13224 1484 aa37.04■■■■□ 3.52
HLA-L-211ENST00000482052 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
HLA-L-211ENST00000482052 CLIP1P30622 1438 aa36.96■■■■□ 3.51
HLA-L-211ENST00000482052 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
HLA-L-211ENST00000482052 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.9■■■■□ 3.5
HLA-L-211ENST00000482052 ADAMTS12P58397 1594 aa36.87■■■■□ 3.49
HLA-L-211ENST00000482052 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.83■■■■□ 3.49
HLA-L-211ENST00000482052 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
HLA-L-211ENST00000482052 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.67■■■■□ 3.46
HLA-L-211ENST00000482052 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.65■■■■□ 3.46
HLA-L-211ENST00000482052 ARAP1Q96P48 1450 aa36.62■■■■□ 3.45
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