Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARBP10826 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARBP10826 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARBP10826 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARBP10826 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARBP10826 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARBP10826 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARBP10826 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARBP10826 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RARBP10826 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARBP10826 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARBP10826 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARBP10826 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARBP10826 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARBP10826 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARBP10826 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARBP10826 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARBP10826 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARBP10826 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARBP10826 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms