RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393812.3

SLC35B2-202, Transcript of solute carrier family 35 member B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35B2, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B2-202ENST00000393812 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.16■■■■■ 6.1
SLC35B2-202ENST00000393812 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.29■■■■■ 5
SLC35B2-202ENST00000393812 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
SLC35B2-202ENST00000393812 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.01■■■■■ 4.64
SLC35B2-202ENST00000393812 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.74■■■■■ 4.59
SLC35B2-202ENST00000393812 ABCC9O60706 1549 aa43.57■■■■■ 4.56
SLC35B2-202ENST00000393812 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.44■■■■■ 4.55
SLC35B2-202ENST00000393812 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.35■■■■■ 4.53
SLC35B2-202ENST00000393812 NACADO15069 1562 aa43.09■■■■■ 4.49
SLC35B2-202ENST00000393812 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.66■■■■■ 4.42
SLC35B2-202ENST00000393812 SCRIBQ14160 1630 aa42.52■■■■■ 4.4
SLC35B2-202ENST00000393812 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SLC35B2-202ENST00000393812 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.79■■■■■ 4.28
SLC35B2-202ENST00000393812 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.38■■■■■ 4.22
SLC35B2-202ENST00000393812 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
SLC35B2-202ENST00000393812 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC35B2-202ENST00000393812 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
SLC35B2-202ENST00000393812 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC35B2-202ENST00000393812 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
SLC35B2-202ENST00000393812 SMARCA4P51532 1647 aa40.82■■■■■ 4.12
SLC35B2-202ENST00000393812 WIZO95785 1651 aa40.71■■■■■ 4.11
SLC35B2-202ENST00000393812 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.36■■■■■ 4.05
SLC35B2-202ENST00000393812 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
SLC35B2-202ENST00000393812 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC35B2-202ENST00000393812 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.12■■■■■ 4.01
SLC35B2-202ENST00000393812 SMARCA2P51531 1590 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC35B2-202ENST00000393812 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
SLC35B2-202ENST00000393812 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.9■■■■□ 3.98
SLC35B2-202ENST00000393812 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.97
SLC35B2-202ENST00000393812 NCAPD3P42695 1498 aa39.78■■■■□ 3.96
SLC35B2-202ENST00000393812 HMGXB3Q12766 1538 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC35B2-202ENST00000393812 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.46■■■■□ 3.91
SLC35B2-202ENST00000393812 TRIM41Q8WV44 630 aa39.33■■■■□ 3.89
SLC35B2-202ENST00000393812 ABCC8Q09428 1581 aa39.07■■■■□ 3.85
SLC35B2-202ENST00000393812 CFTRP13569 1480 aa38.93■■■■□ 3.82
SLC35B2-202ENST00000393812 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.85■■■■□ 3.81
SLC35B2-202ENST00000393812 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.75■■■■□ 3.79
SLC35B2-202ENST00000393812 PRDM2Q13029 1718 aa38.71■■■■□ 3.79
SLC35B2-202ENST00000393812 SYNJ1O43426 1573 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC35B2-202ENST00000393812 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.58■■■■□ 3.77
SLC35B2-202ENST00000393812 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
SLC35B2-202ENST00000393812 TOP2BQ02880 1626 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC35B2-202ENST00000393812 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.49■■■■□ 3.75
SLC35B2-202ENST00000393812 EEA1Q15075 1411 aa38.41■■■■□ 3.74
SLC35B2-202ENST00000393812 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.4■■■■□ 3.74
SLC35B2-202ENST00000393812 SOGA1O94964 1423 aa38.39■■■■□ 3.74
SLC35B2-202ENST00000393812 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.39■■■■□ 3.74
SLC35B2-202ENST00000393812 CUX1P39880 1505 aa38.38■■■■□ 3.73
SLC35B2-202ENST00000393812 NESP48681 1621 aa38.31■■■■□ 3.72
SLC35B2-202ENST00000393812 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.3■■■■□ 3.72
SLC35B2-202ENST00000393812 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.23■■■■□ 3.71
SLC35B2-202ENST00000393812 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.15■■■■□ 3.7
SLC35B2-202ENST00000393812 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.08■■■■□ 3.69
SLC35B2-202ENST00000393812 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC35B2-202ENST00000393812 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.99■■■■□ 3.67
SLC35B2-202ENST00000393812 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.95■■■■□ 3.67
SLC35B2-202ENST00000393812 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.92■■■■□ 3.66
SLC35B2-202ENST00000393812 TOPBP1Q92547 1522 aa37.91■■■■□ 3.66
SLC35B2-202ENST00000393812 KIF21BO75037 1637 aa37.88■■■■□ 3.65
SLC35B2-202ENST00000393812 KIF27Q86VH2 1401 aa37.86■■■■□ 3.65
SLC35B2-202ENST00000393812 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC35B2-202ENST00000393812 GOLGA3Q08378 1498 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC35B2-202ENST00000393812 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
SLC35B2-202ENST00000393812 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC35B2-202ENST00000393812 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
SLC35B2-202ENST00000393812 CUX2O14529 1486 aa37.7■■■■□ 3.63
SLC35B2-202ENST00000393812 PRXQ9BXM0 1461 aa37.66■■■■□ 3.62
SLC35B2-202ENST00000393812 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.61
SLC35B2-202ENST00000393812 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
SLC35B2-202ENST00000393812 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC35B2-202ENST00000393812 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC35B2-202ENST00000393812 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC35B2-202ENST00000393812 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.56■■■■□ 3.6
SLC35B2-202ENST00000393812 CEP162Q5TB80 1403 aa37.55■■■■□ 3.6
SLC35B2-202ENST00000393812 IGF1RP08069 1367 aa37.52■■■■□ 3.6
SLC35B2-202ENST00000393812 WDR97A6NE52 1622 aa37.48■■■■□ 3.59
SLC35B2-202ENST00000393812 WDR62O43379 1518 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC35B2-202ENST00000393812 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
SLC35B2-202ENST00000393812 ERCC6Q03468 1493 aa37.34■■■■□ 3.57
SLC35B2-202ENST00000393812 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.32■■■■□ 3.57
SLC35B2-202ENST00000393812 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.3■■■■□ 3.56
SLC35B2-202ENST00000393812 CLIP1P30622 1438 aa37.23■■■■□ 3.55
SLC35B2-202ENST00000393812 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
SLC35B2-202ENST00000393812 CUL7Q14999 1698 aa37.21■■■■□ 3.55
SLC35B2-202ENST00000393812 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
SLC35B2-202ENST00000393812 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.21■■■■□ 3.55
SLC35B2-202ENST00000393812 IFT140Q96RY7 1462 aa37.14■■■■□ 3.54
SLC35B2-202ENST00000393812 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
SLC35B2-202ENST00000393812 PBRM1Q86U86 1689 aa36.96■■■■□ 3.51
SLC35B2-202ENST00000393812 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.511e-6■■■■■ 40.2
SLC35B2-202ENST00000393812 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.95■■■■□ 3.51
SLC35B2-202ENST00000393812 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC35B2-202ENST00000393812 GRIN2BQ13224 1484 aa36.9■■■■□ 3.5
SLC35B2-202ENST00000393812 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
SLC35B2-202ENST00000393812 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
SLC35B2-202ENST00000393812 ARAP1Q96P48 1450 aa36.86■■■■□ 3.49
SLC35B2-202ENST00000393812 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC35B2-202ENST00000393812 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.82■■■■□ 3.48
SLC35B2-202ENST00000393812 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.79■■■■□ 3.48
SLC35B2-202ENST00000393812 ADAMTS12P58397 1594 aa36.79■■■■□ 3.48
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