RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378362.3

GFRA3-202, Transcript of GDNF family receptor alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA3, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3-202ENST00000378362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.97■■■■■ 6.07
GFRA3-202ENST00000378362 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.88■■■■■ 5.1
GFRA3-202ENST00000378362 ABCC9O60706 1549 aa46.18■■■■■ 4.98
GFRA3-202ENST00000378362 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.61■■■■■ 4.73
GFRA3-202ENST00000378362 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.19■■■■■ 4.66
GFRA3-202ENST00000378362 NACADO15069 1562 aa44.11■■■■■ 4.65
GFRA3-202ENST00000378362 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
GFRA3-202ENST00000378362 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.74■■■■■ 4.59
GFRA3-202ENST00000378362 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.63■■■■■ 4.57
GFRA3-202ENST00000378362 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.32■■■■■ 4.53
GFRA3-202ENST00000378362 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.29■■■■■ 4.52
GFRA3-202ENST00000378362 SCRIBQ14160 1630 aa43.08■■■■■ 4.49
GFRA3-202ENST00000378362 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.96■■■■■ 4.47
GFRA3-202ENST00000378362 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.46■■■■■ 4.39
GFRA3-202ENST00000378362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.25■■■■■ 4.35
GFRA3-202ENST00000378362 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
GFRA3-202ENST00000378362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.67■■■■■ 4.26
GFRA3-202ENST00000378362 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.43■■■■■ 4.22
GFRA3-202ENST00000378362 SMARCA4P51532 1647 aa41.08■■■■■ 4.17
GFRA3-202ENST00000378362 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
GFRA3-202ENST00000378362 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.93■■■■■ 4.14
GFRA3-202ENST00000378362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.87■■■■■ 4.13
GFRA3-202ENST00000378362 NCAPD3P42695 1498 aa40.76■■■■■ 4.12
GFRA3-202ENST00000378362 SMARCA2P51531 1590 aa40.71■■■■■ 4.11
GFRA3-202ENST00000378362 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.56■■■■■ 4.08
GFRA3-202ENST00000378362 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
GFRA3-202ENST00000378362 WIZO95785 1651 aa40.52■■■■■ 4.08
GFRA3-202ENST00000378362 HMGXB3Q12766 1538 aa40.51■■■■■ 4.08
GFRA3-202ENST00000378362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
GFRA3-202ENST00000378362 NESP48681 1621 aa40.01■■■■■ 4
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GFRA3-202ENST00000378362 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
GFRA3-202ENST00000378362 ERCC6Q03468 1493 aa39.71■■■■□ 3.95
GFRA3-202ENST00000378362 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.65■■■■□ 3.94
GFRA3-202ENST00000378362 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.64■■■■□ 3.94
GFRA3-202ENST00000378362 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.59■■■■□ 3.93
GFRA3-202ENST00000378362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.43■■■■□ 3.9
GFRA3-202ENST00000378362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.42■■■■□ 3.9
GFRA3-202ENST00000378362 CFTRP13569 1480 aa39.39■■■■□ 3.9
GFRA3-202ENST00000378362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.22■■■■□ 3.87
GFRA3-202ENST00000378362 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
GFRA3-202ENST00000378362 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.12■■■■□ 3.85
GFRA3-202ENST00000378362 CUX2O14529 1486 aa39.08■■■■□ 3.85
GFRA3-202ENST00000378362 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.04■■■■□ 3.84
GFRA3-202ENST00000378362 PRDM2Q13029 1718 aa39.01■■■■□ 3.83
GFRA3-202ENST00000378362 WDR62O43379 1518 aa38.87■■■■□ 3.81
GFRA3-202ENST00000378362 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
GFRA3-202ENST00000378362 TOPBP1Q92547 1522 aa38.59■■■■□ 3.77
GFRA3-202ENST00000378362 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.48■■■■□ 3.75
GFRA3-202ENST00000378362 ABCC8Q09428 1581 aa38.41■■■■□ 3.74
GFRA3-202ENST00000378362 CUX1P39880 1505 aa38.37■■■■□ 3.73
GFRA3-202ENST00000378362 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
GFRA3-202ENST00000378362 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
GFRA3-202ENST00000378362 IFT140Q96RY7 1462 aa38.26■■■■□ 3.71
GFRA3-202ENST00000378362 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.24■■■■□ 3.71
GFRA3-202ENST00000378362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.22■■■■□ 3.71
GFRA3-202ENST00000378362 SOGA1O94964 1423 aa38.16■■■■□ 3.7
GFRA3-202ENST00000378362 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
GFRA3-202ENST00000378362 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
GFRA3-202ENST00000378362 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.09■■■■□ 3.69
GFRA3-202ENST00000378362 SYNJ1O43426 1573 aa38.07■■■■□ 3.68
GFRA3-202ENST00000378362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
GFRA3-202ENST00000378362 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.01■■■■□ 3.67
GFRA3-202ENST00000378362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
GFRA3-202ENST00000378362 TOP2BQ02880 1626 aa37.96■■■■□ 3.67
GFRA3-202ENST00000378362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.92■■■■□ 3.66
GFRA3-202ENST00000378362 WDR97A6NE52 1622 aa37.79■■■■□ 3.64
GFRA3-202ENST00000378362 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.76■■■■□ 3.64
GFRA3-202ENST00000378362 FBLN2P98095 1184 aa37.72■■■■□ 3.63
GFRA3-202ENST00000378362 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.68■■■■□ 3.62
GFRA3-202ENST00000378362 OSCARQ8IYS5 282 aa37.66■■■■□ 3.62
GFRA3-202ENST00000378362 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.64■■■■□ 3.62
GFRA3-202ENST00000378362 GRIN2BQ13224 1484 aa37.62■■■■□ 3.61
GFRA3-202ENST00000378362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.6■■■■□ 3.61
GFRA3-202ENST00000378362 PBRM1Q86U86 1689 aa37.56■■■■□ 3.6
GFRA3-202ENST00000378362 CHD1O14646 1710 aa37.55■■■■□ 3.6
GFRA3-202ENST00000378362 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
GFRA3-202ENST00000378362 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
GFRA3-202ENST00000378362 TRIM41Q8WV44 630 aa37.4■■■■□ 3.58
GFRA3-202ENST00000378362 SYNJ2O15056 1496 aa37.36■■■■□ 3.57
GFRA3-202ENST00000378362 KIF27Q86VH2 1401 aa37.27■■■■□ 3.56
GFRA3-202ENST00000378362 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.27■■■■□ 3.56
GFRA3-202ENST00000378362 ADAMTS12P58397 1594 aa37.25■■■■□ 3.55
GFRA3-202ENST00000378362 IGF1RP08069 1367 aa37.2■■■■□ 3.55
GFRA3-202ENST00000378362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.19■■■■□ 3.54
GFRA3-202ENST00000378362 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.19■■■■□ 3.54
GFRA3-202ENST00000378362 GRIN2AQ12879 1464 aa37.16■■■■□ 3.54
GFRA3-202ENST00000378362 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 CEP170Q5SW79 1584 aa37.02■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.02■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 ARHGEF11O15085 1522 aa37.02■■■■□ 3.52
GFRA3-202ENST00000378362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.97■■■■□ 3.51
GFRA3-202ENST00000378362 NUP160Q12769 1436 aa36.95■■■■□ 3.51
GFRA3-202ENST00000378362 CUL7Q14999 1698 aa36.92■■■■□ 3.5
GFRA3-202ENST00000378362 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.86■■■■□ 3.49
GFRA3-202ENST00000378362 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
GFRA3-202ENST00000378362 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.76■■■■□ 3.47
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