RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381072.5

PFKP-201, Transcript of phosphofructokinase, platelet, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PFKP, Length 1,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKP-201ENST00000381072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.36■■■■■ 6.13
PFKP-201ENST00000381072 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.85■■■■■ 5.09
PFKP-201ENST00000381072 ABCC9O60706 1549 aa45.06■■■■■ 4.8
PFKP-201ENST00000381072 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
PFKP-201ENST00000381072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.29■■■■■ 4.68
PFKP-201ENST00000381072 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.07■■■■■ 4.65
PFKP-201ENST00000381072 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.82■■■■■ 4.61
PFKP-201ENST00000381072 NACADO15069 1562 aa43.81■■■■■ 4.6
PFKP-201ENST00000381072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.62■■■■■ 4.57
PFKP-201ENST00000381072 SCRIBQ14160 1630 aa43.04■■■■■ 4.48
PFKP-201ENST00000381072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.02■■■■■ 4.48
PFKP-201ENST00000381072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.8■■■■■ 4.44
PFKP-201ENST00000381072 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.41■■■■■ 4.38
PFKP-201ENST00000381072 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.35■■■■■ 4.37
PFKP-201ENST00000381072 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.58■■■■■ 4.25
PFKP-201ENST00000381072 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.23■■■■■ 4.19
PFKP-201ENST00000381072 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
PFKP-201ENST00000381072 SMARCA4P51532 1647 aa41.18■■■■■ 4.18
PFKP-201ENST00000381072 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
PFKP-201ENST00000381072 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
PFKP-201ENST00000381072 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
PFKP-201ENST00000381072 WIZO95785 1651 aa40.85■■■■■ 4.13
PFKP-201ENST00000381072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.74■■■■■ 4.11
PFKP-201ENST00000381072 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.7■■■■■ 4.11
PFKP-201ENST00000381072 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.69■■■■■ 4.11
PFKP-201ENST00000381072 SMARCA2P51531 1590 aa40.6■■■■■ 4.09
PFKP-201ENST00000381072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.51■■■■■ 4.08
PFKP-201ENST00000381072 NCAPD3P42695 1498 aa40.46■■■■■ 4.07
PFKP-201ENST00000381072 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
PFKP-201ENST00000381072 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
PFKP-201ENST00000381072 HMGXB3Q12766 1538 aa40.33■■■■■ 4.05
PFKP-201ENST00000381072 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.96■■■■□ 3.99
PFKP-201ENST00000381072 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.36■■■■□ 3.89
PFKP-201ENST00000381072 CFTRP13569 1480 aa39.36■■■■□ 3.89
PFKP-201ENST00000381072 NESP48681 1621 aa39.35■■■■□ 3.89
PFKP-201ENST00000381072 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.19■■■■□ 3.86
PFKP-201ENST00000381072 PRDM2Q13029 1718 aa39.09■■■■□ 3.85
PFKP-201ENST00000381072 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.94■■■■□ 3.82
PFKP-201ENST00000381072 ABCC8Q09428 1581 aa38.91■■■■□ 3.82
PFKP-201ENST00000381072 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.88■■■■□ 3.81
PFKP-201ENST00000381072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.84■■■■□ 3.81
PFKP-201ENST00000381072 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.81■■■■□ 3.8
PFKP-201ENST00000381072 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.75■■■■□ 3.79
PFKP-201ENST00000381072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.78
PFKP-201ENST00000381072 ERCC6Q03468 1493 aa38.65■■■■□ 3.78
PFKP-201ENST00000381072 SYNJ1O43426 1573 aa38.61■■■■□ 3.77
PFKP-201ENST00000381072 CUX1P39880 1505 aa38.6■■■■□ 3.77
PFKP-201ENST00000381072 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
PFKP-201ENST00000381072 TRIM41Q8WV44 630 aa38.52■■■■□ 3.76
PFKP-201ENST00000381072 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
PFKP-201ENST00000381072 TOP2BQ02880 1626 aa38.47■■■■□ 3.75
PFKP-201ENST00000381072 TOPBP1Q92547 1522 aa38.45■■■■□ 3.75
PFKP-201ENST00000381072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.44■■■■□ 3.74
PFKP-201ENST00000381072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.44■■■■□ 3.74
PFKP-201ENST00000381072 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
PFKP-201ENST00000381072 WDR62O43379 1518 aa38.32■■■■□ 3.72
PFKP-201ENST00000381072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.27■■■■□ 3.72
PFKP-201ENST00000381072 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
PFKP-201ENST00000381072 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.1■■■■□ 3.69
PFKP-201ENST00000381072 CUX2O14529 1486 aa38.07■■■■□ 3.69
PFKP-201ENST00000381072 SOGA1O94964 1423 aa38.04■■■■□ 3.68
PFKP-201ENST00000381072 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
PFKP-201ENST00000381072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.94■■■■□ 3.66
PFKP-201ENST00000381072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.89■■■■□ 3.66
PFKP-201ENST00000381072 WDR97A6NE52 1622 aa37.88■■■■□ 3.66
PFKP-201ENST00000381072 IFT140Q96RY7 1462 aa37.87■■■■□ 3.65
PFKP-201ENST00000381072 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
PFKP-201ENST00000381072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
PFKP-201ENST00000381072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
PFKP-201ENST00000381072 KIF27Q86VH2 1401 aa37.74■■■■□ 3.63
PFKP-201ENST00000381072 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.68■■■■□ 3.623e-6■■■■■ 30.9
PFKP-201ENST00000381072 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.67■■■■□ 3.62
PFKP-201ENST00000381072 EEA1Q15075 1411 aa37.64■■■■□ 3.62
PFKP-201ENST00000381072 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.61■■■■□ 3.61
PFKP-201ENST00000381072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
PFKP-201ENST00000381072 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.56■■■■□ 3.6
PFKP-201ENST00000381072 IGF1RP08069 1367 aa37.54■■■■□ 3.6
PFKP-201ENST00000381072 PBRM1Q86U86 1689 aa37.47■■■■□ 3.59
PFKP-201ENST00000381072 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.42■■■■□ 3.58
PFKP-201ENST00000381072 GRIN2BQ13224 1484 aa37.42■■■■□ 3.58
PFKP-201ENST00000381072 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.39■■■■□ 3.58
PFKP-201ENST00000381072 PRXQ9BXM0 1461 aa37.34■■■■□ 3.57
PFKP-201ENST00000381072 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.34■■■■□ 3.57
PFKP-201ENST00000381072 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.31■■■■□ 3.56
PFKP-201ENST00000381072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.31■■■■□ 3.56
PFKP-201ENST00000381072 CUL7Q14999 1698 aa37.27■■■■□ 3.56
PFKP-201ENST00000381072 KIF21BO75037 1637 aa37.26■■■■□ 3.55
PFKP-201ENST00000381072 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.25■■■■□ 3.55
PFKP-201ENST00000381072 ADAMTS12P58397 1594 aa37.24■■■■□ 3.55
PFKP-201ENST00000381072 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
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PFKP-201ENST00000381072 GOLGA3Q08378 1498 aa37.14■■■■□ 3.54
PFKP-201ENST00000381072 SYNJ2O15056 1496 aa37.06■■■■□ 3.52
PFKP-201ENST00000381072 FBLN2P98095 1184 aa37.01■■■■□ 3.52
PFKP-201ENST00000381072 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
PFKP-201ENST00000381072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
PFKP-201ENST00000381072 GRIN2AQ12879 1464 aa36.99■■■■□ 3.51
PFKP-201ENST00000381072 CHD1O14646 1710 aa36.94■■■■□ 3.5
PFKP-201ENST00000381072 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.87■■■■□ 3.49
PFKP-201ENST00000381072 CEP170Q5SW79 1584 aa36.82■■■■□ 3.48
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