RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416495.6

SESN3-202, Transcript of sestrin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SESN3, Length 1,408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3-202ENST00000416495 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.37■■■■■ 6.13
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SESN3-202ENST00000416495 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.07■■■■■ 4.8
SESN3-202ENST00000416495 NACADO15069 1562 aa44.93■■■■■ 4.78
SESN3-202ENST00000416495 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.65■■■■■ 4.74
SESN3-202ENST00000416495 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.58■■■■■ 4.73
SESN3-202ENST00000416495 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
SESN3-202ENST00000416495 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.2■■■■■ 4.67
SESN3-202ENST00000416495 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.06■■■■■ 4.64
SESN3-202ENST00000416495 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.81■■■■■ 4.6
SESN3-202ENST00000416495 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.73■■■■■ 4.59
SESN3-202ENST00000416495 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.56■■■■■ 4.56
SESN3-202ENST00000416495 SCRIBQ14160 1630 aa43.38■■■■■ 4.53
SESN3-202ENST00000416495 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.29■■■■■ 4.52
SESN3-202ENST00000416495 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
SESN3-202ENST00000416495 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.53■■■■■ 4.4
SESN3-202ENST00000416495 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.3■■■■■ 4.36
SESN3-202ENST00000416495 SMARCA4P51532 1647 aa41.5■■■■■ 4.23
SESN3-202ENST00000416495 NCAPD3P42695 1498 aa41.47■■■■■ 4.23
SESN3-202ENST00000416495 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SESN3-202ENST00000416495 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.39■■■■■ 4.22
SESN3-202ENST00000416495 SMARCA2P51531 1590 aa41.34■■■■■ 4.21
SESN3-202ENST00000416495 HMGXB3Q12766 1538 aa41.22■■■■■ 4.19
SESN3-202ENST00000416495 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.16■■■■■ 4.18
SESN3-202ENST00000416495 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.1■■■■■ 4.17
SESN3-202ENST00000416495 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
SESN3-202ENST00000416495 WIZO95785 1651 aa40.63■■■■■ 4.09
SESN3-202ENST00000416495 NESP48681 1621 aa40.53■■■■■ 4.08
SESN3-202ENST00000416495 ERCC6Q03468 1493 aa40.53■■■■■ 4.08
SESN3-202ENST00000416495 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
SESN3-202ENST00000416495 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.44■■■■■ 4.06
SESN3-202ENST00000416495 CUX2O14529 1486 aa40.34■■■■■ 4.05
SESN3-202ENST00000416495 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.21■■■■■ 4.03
SESN3-202ENST00000416495 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
SESN3-202ENST00000416495 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.16■■■■■ 4.02
SESN3-202ENST00000416495 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.07■■■■■ 4.01
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SESN3-202ENST00000416495 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.73■■■■□ 3.95
SESN3-202ENST00000416495 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.71■■■■□ 3.95
SESN3-202ENST00000416495 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.71■■■■□ 3.95
SESN3-202ENST00000416495 WDR62O43379 1518 aa39.67■■■■□ 3.94
SESN3-202ENST00000416495 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.63■■■■□ 3.93
SESN3-202ENST00000416495 PRDM2Q13029 1718 aa39.57■■■■□ 3.93
SESN3-202ENST00000416495 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
SESN3-202ENST00000416495 ABCC8Q09428 1581 aa39.06■■■■□ 3.84
SESN3-202ENST00000416495 TOPBP1Q92547 1522 aa39.05■■■■□ 3.84
SESN3-202ENST00000416495 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.97■■■■□ 3.83
SESN3-202ENST00000416495 IFT140Q96RY7 1462 aa38.93■■■■□ 3.82
SESN3-202ENST00000416495 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.75■■■■□ 3.79
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SESN3-202ENST00000416495 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
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SESN3-202ENST00000416495 CUX1P39880 1505 aa38.58■■■■□ 3.77
SESN3-202ENST00000416495 OSCARQ8IYS5 282 aa38.56■■■■□ 3.76
SESN3-202ENST00000416495 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.52■■■■□ 3.76
SESN3-202ENST00000416495 SOGA1O94964 1423 aa38.51■■■■□ 3.76
SESN3-202ENST00000416495 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.49■■■■□ 3.75
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SESN3-202ENST00000416495 WDR97A6NE52 1622 aa38.39■■■■□ 3.74
SESN3-202ENST00000416495 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
SESN3-202ENST00000416495 CHD1O14646 1710 aa38.2■■■■□ 3.71
SESN3-202ENST00000416495 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.17■■■■□ 3.7
SESN3-202ENST00000416495 TOP2BQ02880 1626 aa38.16■■■■□ 3.7
SESN3-202ENST00000416495 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.16■■■■□ 3.7
SESN3-202ENST00000416495 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.16■■■■□ 3.7
SESN3-202ENST00000416495 GRIN2BQ13224 1484 aa38.13■■■■□ 3.69
SESN3-202ENST00000416495 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.11■■■■□ 3.69
SESN3-202ENST00000416495 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
SESN3-202ENST00000416495 SYNJ1O43426 1573 aa38.08■■■■□ 3.69
SESN3-202ENST00000416495 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.07■■■■□ 3.68
SESN3-202ENST00000416495 FBLN2P98095 1184 aa38.05■■■■□ 3.68
SESN3-202ENST00000416495 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.04■■■■□ 3.68
SESN3-202ENST00000416495 PBRM1Q86U86 1689 aa38.02■■■■□ 3.68
SESN3-202ENST00000416495 TRIM41Q8WV44 630 aa38.01■■■■□ 3.68
SESN3-202ENST00000416495 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.99■■■■□ 3.67
SESN3-202ENST00000416495 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.99■■■■□ 3.67
SESN3-202ENST00000416495 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.99■■■■□ 3.67
SESN3-202ENST00000416495 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.96■■■■□ 3.67
SESN3-202ENST00000416495 SYNJ2O15056 1496 aa37.94■■■■□ 3.66
SESN3-202ENST00000416495 ARHGEF11O15085 1522 aa37.93■■■■□ 3.66
SESN3-202ENST00000416495 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
SESN3-202ENST00000416495 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.81■■■■□ 3.64
SESN3-202ENST00000416495 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.7■■■■□ 3.63
SESN3-202ENST00000416495 ADAMTS12P58397 1594 aa37.69■■■■□ 3.62
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SESN3-202ENST00000416495 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.63■■■■□ 3.61
SESN3-202ENST00000416495 ARAP1Q96P48 1450 aa37.6■■■■□ 3.61
SESN3-202ENST00000416495 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.57■■■■□ 3.6
SESN3-202ENST00000416495 NUP160Q12769 1436 aa37.51■■■■□ 3.6
SESN3-202ENST00000416495 CEP170Q5SW79 1584 aa37.47■■■■□ 3.59
SESN3-202ENST00000416495 KIF27Q86VH2 1401 aa37.41■■■■□ 3.58
SESN3-202ENST00000416495 IGF1RP08069 1367 aa37.33■■■■□ 3.57
SESN3-202ENST00000416495 SHROOM2Q13796 1616 aa37.3■■■■□ 3.56
SESN3-202ENST00000416495 EEA1Q15075 1411 aa37.29■■■■□ 3.56
SESN3-202ENST00000416495 CUL7Q14999 1698 aa37.26■■■■□ 3.56
SESN3-202ENST00000416495 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.2■■■■□ 3.55
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