Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB23Q9ULC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB23Q9ULC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB23Q9ULC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB23Q9ULC3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms