Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RAB23Q9ULC3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RAB23Q9ULC3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RAB23Q9ULC3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RAB23Q9ULC3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RAB23Q9ULC3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAB23Q9ULC3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAB23Q9ULC3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAB23Q9ULC3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAB23Q9ULC3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RAB23Q9ULC3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB23Q9ULC3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB23Q9ULC3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAB23Q9ULC3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB23Q9ULC3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAB23Q9ULC3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RAB23Q9ULC3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RAB23Q9ULC3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAB23Q9ULC3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAB23Q9ULC3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB23Q9ULC3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB23Q9ULC3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB23Q9ULC3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RAB23Q9ULC3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RAB23Q9ULC3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RAB23Q9ULC3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RAB23Q9ULC3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RAB23Q9ULC3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
RAB23Q9ULC3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
RAB23Q9ULC3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RAB23Q9ULC3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RAB23Q9ULC3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RAB23Q9ULC3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RAB23Q9ULC3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB23Q9ULC3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
RAB23Q9ULC3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAB23Q9ULC3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RAB23Q9ULC3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RAB23Q9ULC3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAB23Q9ULC3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB23Q9ULC3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB23Q9ULC3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB23Q9ULC3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB23Q9ULC3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB23Q9ULC3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB23Q9ULC3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB23Q9ULC3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB23Q9ULC3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB23Q9ULC3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAB23Q9ULC3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB23Q9ULC3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RAB23Q9ULC3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RAB23Q9ULC3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAB23Q9ULC3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAB23Q9ULC3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAB23Q9ULC3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RAB23Q9ULC3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAB23Q9ULC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAB23Q9ULC3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAB23Q9ULC3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RAB23Q9ULC3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAB23Q9ULC3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAB23Q9ULC3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAB23Q9ULC3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAB23Q9ULC3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RAB23Q9ULC3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAB23Q9ULC3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RAB23Q9ULC3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAB23Q9ULC3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RAB23Q9ULC3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RAB23Q9ULC3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB23Q9ULC3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB23Q9ULC3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB23Q9ULC3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB23Q9ULC3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAB23Q9ULC3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB23Q9ULC3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB23Q9ULC3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB23Q9ULC3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB23Q9ULC3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAB23Q9ULC3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB23Q9ULC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAB23Q9ULC3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB23Q9ULC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB23Q9ULC3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB23Q9ULC3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAB23Q9ULC3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAB23Q9ULC3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAB23Q9ULC3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAB23Q9ULC3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB23Q9ULC3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAB23Q9ULC3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms