RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426677.6

TOMM40-203, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-203ENST00000426677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.38■■■■■ 6.62
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TOMM40-203ENST00000426677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.23■■■■■ 4.51
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TOMM40-203ENST00000426677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
TOMM40-203ENST00000426677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.02■■■■■ 4.48
TOMM40-203ENST00000426677 SMARCA2P51531 1590 aa42.94■■■■■ 4.46
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TOMM40-203ENST00000426677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.5■■■■■ 4.23
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TOMM40-203ENST00000426677 ABCC8Q09428 1581 aa41.14■■■■■ 4.18
TOMM40-203ENST00000426677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.11■■■■■ 4.17
TOMM40-203ENST00000426677 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.01■■■■■ 4.15
TOMM40-203ENST00000426677 ERCC6Q03468 1493 aa40.95■■■■■ 4.15
TOMM40-203ENST00000426677 SYNJ1O43426 1573 aa40.84■■■■■ 4.13
TOMM40-203ENST00000426677 CUX1P39880 1505 aa40.82■■■■■ 4.13
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TOMM40-203ENST00000426677 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.8■■■■■ 4.12
TOMM40-203ENST00000426677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
TOMM40-203ENST00000426677 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.73■■■■■ 4.11
TOMM40-203ENST00000426677 TOPBP1Q92547 1522 aa40.68■■■■■ 4.1
TOMM40-203ENST00000426677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.68■■■■■ 4.1
TOMM40-203ENST00000426677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.67■■■■■ 4.1
TOMM40-203ENST00000426677 TOP2BQ02880 1626 aa40.66■■■■■ 4.1
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TOMM40-203ENST00000426677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.47■■■■■ 4.07
TOMM40-203ENST00000426677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
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TOMM40-203ENST00000426677 WDR97A6NE52 1622 aa40.16■■■■■ 4.02
TOMM40-203ENST00000426677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.08■■■■■ 4.01
TOMM40-203ENST00000426677 IFT140Q96RY7 1462 aa40.05■■■■■ 4
TOMM40-203ENST00000426677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.04■■■■■ 4
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TOMM40-203ENST00000426677 PBRM1Q86U86 1689 aa39.75■■■■□ 3.95
TOMM40-203ENST00000426677 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.75■■■■□ 3.95
TOMM40-203ENST00000426677 EEA1Q15075 1411 aa39.61■■■■□ 3.93
TOMM40-203ENST00000426677 IGF1RP08069 1367 aa39.6■■■■□ 3.93
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TOMM40-203ENST00000426677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.54■■■■□ 3.92
TOMM40-203ENST00000426677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.49■■■■□ 3.91
TOMM40-203ENST00000426677 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.44■■■■□ 3.9
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TOMM40-203ENST00000426677 PRXQ9BXM0 1461 aa39.38■■■■□ 3.9
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TOMM40-203ENST00000426677 KIF21BO75037 1637 aa39.33■■■■□ 3.89
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TOMM40-203ENST00000426677 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.27■■■■□ 3.88
TOMM40-203ENST00000426677 CHD1O14646 1710 aa39.24■■■■□ 3.87
TOMM40-203ENST00000426677 SYNJ2O15056 1496 aa39.2■■■■□ 3.87
TOMM40-203ENST00000426677 FBLN2P98095 1184 aa39.14■■■■□ 3.86
TOMM40-203ENST00000426677 GOLGA3Q08378 1498 aa39.13■■■■□ 3.85
TOMM40-203ENST00000426677 GRIN2AQ12879 1464 aa39.13■■■■□ 3.85
TOMM40-203ENST00000426677 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
TOMM40-203ENST00000426677 CEP170Q5SW79 1584 aa39■■■■□ 3.83
TOMM40-203ENST00000426677 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
TOMM40-203ENST00000426677 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.95■■■■□ 3.83
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