RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.24■■■■■ 6.27
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.26■■■■■ 5.32
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCC9O60706 1549 aa47.33■■■■■ 5.17
SLC35A3-216ENST00000639221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.54■■■■■ 4.88
SLC35A3-216ENST00000639221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.54■■■■■ 4.88
SLC35A3-216ENST00000639221 NACADO15069 1562 aa45.46■■■■■ 4.87
SLC35A3-216ENST00000639221 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.15■■■■■ 4.82
SLC35A3-216ENST00000639221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
SLC35A3-216ENST00000639221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.91■■■■■ 4.78
SLC35A3-216ENST00000639221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.27■■■■■ 4.68
SLC35A3-216ENST00000639221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.23■■■■■ 4.67
SLC35A3-216ENST00000639221 SCRIBQ14160 1630 aa44.01■■■■■ 4.64
SLC35A3-216ENST00000639221 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.98■■■■■ 4.63
SLC35A3-216ENST00000639221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.73■■■■■ 4.59
SLC35A3-216ENST00000639221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.41■■■■■ 4.54
SLC35A3-216ENST00000639221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
SLC35A3-216ENST00000639221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.77■■■■■ 4.44
SLC35A3-216ENST00000639221 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.57■■■■■ 4.41
SLC35A3-216ENST00000639221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
SLC35A3-216ENST00000639221 SMARCA4P51532 1647 aa42.08■■■■■ 4.33
SLC35A3-216ENST00000639221 SMARCA2P51531 1590 aa41.93■■■■■ 4.3
SLC35A3-216ENST00000639221 NCAPD3P42695 1498 aa41.92■■■■■ 4.3
SLC35A3-216ENST00000639221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.91■■■■■ 4.3
SLC35A3-216ENST00000639221 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.75■■■■■ 4.27
SLC35A3-216ENST00000639221 HMGXB3Q12766 1538 aa41.69■■■■■ 4.27
SLC35A3-216ENST00000639221 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.67■■■■■ 4.26
SLC35A3-216ENST00000639221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
SLC35A3-216ENST00000639221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SLC35A3-216ENST00000639221 WIZO95785 1651 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC35A3-216ENST00000639221 ERCC6Q03468 1493 aa40.92■■■■■ 4.14
SLC35A3-216ENST00000639221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
SLC35A3-216ENST00000639221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.85■■■■■ 4.13
SLC35A3-216ENST00000639221 NESP48681 1621 aa40.85■■■■■ 4.13
SLC35A3-216ENST00000639221 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC35A3-216ENST00000639221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.67■■■■■ 4.1
SLC35A3-216ENST00000639221 CUX2O14529 1486 aa40.46■■■■■ 4.07
SLC35A3-216ENST00000639221 CFTRP13569 1480 aa40.44■■■■■ 4.06
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.34■■■■■ 4.05
SLC35A3-216ENST00000639221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
SLC35A3-216ENST00000639221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.25■■■■■ 4.03
SLC35A3-216ENST00000639221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
SLC35A3-216ENST00000639221 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.24■■■■■ 4.03
SLC35A3-216ENST00000639221 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.18■■■■■ 4.02
SLC35A3-216ENST00000639221 PRDM2Q13029 1718 aa40.04■■■■■ 4
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR62O43379 1518 aa39.99■■■■□ 3.99
SLC35A3-216ENST00000639221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCC8Q09428 1581 aa39.69■■■■□ 3.94
SLC35A3-216ENST00000639221 TOPBP1Q92547 1522 aa39.56■■■■□ 3.92
SLC35A3-216ENST00000639221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.52■■■■□ 3.92
SLC35A3-216ENST00000639221 IFT140Q96RY7 1462 aa39.41■■■■□ 3.9
SLC35A3-216ENST00000639221 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.33■■■■□ 3.89
SLC35A3-216ENST00000639221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
SLC35A3-216ENST00000639221 CUX1P39880 1505 aa39.18■■■■□ 3.86
SLC35A3-216ENST00000639221 SOGA1O94964 1423 aa39.14■■■■□ 3.86
SLC35A3-216ENST00000639221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.11■■■■□ 3.85
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
SLC35A3-216ENST00000639221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
SLC35A3-216ENST00000639221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.02■■■■□ 3.84
SLC35A3-216ENST00000639221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39■■■■□ 3.83
SLC35A3-216ENST00000639221 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
SLC35A3-216ENST00000639221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.93■■■■□ 3.82
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR97A6NE52 1622 aa38.89■■■■□ 3.82
SLC35A3-216ENST00000639221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
SLC35A3-216ENST00000639221 OSCARQ8IYS5 282 aa38.86■■■■□ 3.81
SLC35A3-216ENST00000639221 TOP2BQ02880 1626 aa38.85■■■■□ 3.81
SLC35A3-216ENST00000639221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.82■■■■□ 3.81
SLC35A3-216ENST00000639221 SYNJ1O43426 1573 aa38.78■■■■□ 3.8
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.75■■■■□ 3.79
SLC35A3-216ENST00000639221 GRIN2BQ13224 1484 aa38.69■■■■□ 3.78
SLC35A3-216ENST00000639221 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.66■■■■□ 3.78
SLC35A3-216ENST00000639221 FBLN2P98095 1184 aa38.64■■■■□ 3.78
SLC35A3-216ENST00000639221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.59■■■■□ 3.77
SLC35A3-216ENST00000639221 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
SLC35A3-216ENST00000639221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC35A3-216ENST00000639221 PBRM1Q86U86 1689 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC35A3-216ENST00000639221 CHD1O14646 1710 aa38.46■■■■□ 3.75
SLC35A3-216ENST00000639221 SYNJ2O15056 1496 aa38.43■■■■□ 3.74
SLC35A3-216ENST00000639221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.31■■■■□ 3.72
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF27Q86VH2 1401 aa38.25■■■■□ 3.71
SLC35A3-216ENST00000639221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.23■■■■□ 3.71
SLC35A3-216ENST00000639221 ADAMTS12P58397 1594 aa38.19■■■■□ 3.7
SLC35A3-216ENST00000639221 GRIN2AQ12879 1464 aa38.14■■■■□ 3.7
SLC35A3-216ENST00000639221 TRIM41Q8WV44 630 aa38.13■■■■□ 3.69
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGEF11O15085 1522 aa38.08■■■■□ 3.69
SLC35A3-216ENST00000639221 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.07■■■■□ 3.68
SLC35A3-216ENST00000639221 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC35A3-216ENST00000639221 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC35A3-216ENST00000639221 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC35A3-216ENST00000639221 IGF1RP08069 1367 aa38.02■■■■□ 3.68
SLC35A3-216ENST00000639221 NUP160Q12769 1436 aa37.95■■■■□ 3.67
SLC35A3-216ENST00000639221 CUL7Q14999 1698 aa37.94■■■■□ 3.66
SLC35A3-216ENST00000639221 CEP170Q5SW79 1584 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC35A3-216ENST00000639221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.85■■■■□ 3.65
SLC35A3-216ENST00000639221 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.84■■■■□ 3.65
SLC35A3-216ENST00000639221 ARAP1Q96P48 1450 aa37.74■■■■□ 3.63
SLC35A3-216ENST00000639221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.67■■■■□ 3.62
SLC35A3-216ENST00000639221 JPH4Q96JJ6 628 aa37.67■■■■□ 3.62
SLC35A3-216ENST00000639221 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.62■■■■□ 3.61
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