RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601675.5

PTOV1-220, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTOV1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTOV1-220ENST00000601675 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.63■■■■■ 6.5
PTOV1-220ENST00000601675 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.19■■■■■ 5.46
PTOV1-220ENST00000601675 ABCC9O60706 1549 aa47.7■■■■■ 5.23
PTOV1-220ENST00000601675 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
PTOV1-220ENST00000601675 NACADO15069 1562 aa46.21■■■■■ 4.99
PTOV1-220ENST00000601675 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.19■■■■■ 4.99
PTOV1-220ENST00000601675 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.17■■■■■ 4.98
PTOV1-220ENST00000601675 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.11■■■■■ 4.97
PTOV1-220ENST00000601675 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.1■■■■■ 4.97
PTOV1-220ENST00000601675 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45■■■■■ 4.79
PTOV1-220ENST00000601675 SCRIBQ14160 1630 aa44.85■■■■■ 4.77
PTOV1-220ENST00000601675 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.75■■■■■ 4.75
PTOV1-220ENST00000601675 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.742e-6■■■□□ 16.9
PTOV1-220ENST00000601675 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.34■■■■■ 4.69
PTOV1-220ENST00000601675 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.51■■■■■ 4.56
PTOV1-220ENST00000601675 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
PTOV1-220ENST00000601675 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.28■■■■■ 4.52
PTOV1-220ENST00000601675 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.18■■■■■ 4.5
PTOV1-220ENST00000601675 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
PTOV1-220ENST00000601675 SMARCA4P51532 1647 aa43.01■■■■■ 4.48
PTOV1-220ENST00000601675 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.86■■■■■ 4.45
PTOV1-220ENST00000601675 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.74■■■■■ 4.43
PTOV1-220ENST00000601675 NCAPD3P42695 1498 aa42.7■■■■■ 4.43
PTOV1-220ENST00000601675 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.68■■■■■ 4.42
PTOV1-220ENST00000601675 SMARCA2P51531 1590 aa42.66■■■■■ 4.42
PTOV1-220ENST00000601675 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
PTOV1-220ENST00000601675 HMGXB3Q12766 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
PTOV1-220ENST00000601675 WIZO95785 1651 aa42.36■■■■■ 4.37
PTOV1-220ENST00000601675 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
PTOV1-220ENST00000601675 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
PTOV1-220ENST00000601675 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
PTOV1-220ENST00000601675 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.52■■■■■ 4.24
PTOV1-220ENST00000601675 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.45■■■■■ 4.23
PTOV1-220ENST00000601675 NESP48681 1621 aa41.43■■■■■ 4.22
PTOV1-220ENST00000601675 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.41■■■■■ 4.22
PTOV1-220ENST00000601675 CFTRP13569 1480 aa41.31■■■■■ 4.2
PTOV1-220ENST00000601675 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.14■■■■■ 4.18
PTOV1-220ENST00000601675 ERCC6Q03468 1493 aa41.03■■■■■ 4.16
PTOV1-220ENST00000601675 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.91■■■■■ 4.14
PTOV1-220ENST00000601675 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.87■■■■■ 4.13
PTOV1-220ENST00000601675 PRDM2Q13029 1718 aa40.85■■■■■ 4.13
PTOV1-220ENST00000601675 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.78■■■■■ 4.12
PTOV1-220ENST00000601675 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
PTOV1-220ENST00000601675 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.65■■■■■ 4.1
PTOV1-220ENST00000601675 CUX2O14529 1486 aa40.54■■■■■ 4.08
PTOV1-220ENST00000601675 WDR62O43379 1518 aa40.52■■■■■ 4.08
PTOV1-220ENST00000601675 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
PTOV1-220ENST00000601675 ABCC8Q09428 1581 aa40.37■■■■■ 4.05
PTOV1-220ENST00000601675 TOPBP1Q92547 1522 aa40.31■■■■■ 4.04
PTOV1-220ENST00000601675 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.28■■■■■ 4.04
PTOV1-220ENST00000601675 CUX1P39880 1505 aa40.18■■■■■ 4.02
PTOV1-220ENST00000601675 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.012e-6■■■□□ 16.7
PTOV1-220ENST00000601675 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
PTOV1-220ENST00000601675 IFT140Q96RY7 1462 aa39.95■■■■□ 3.99
PTOV1-220ENST00000601675 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.94■■■■□ 3.98
PTOV1-220ENST00000601675 TOP2BQ02880 1626 aa39.94■■■■□ 3.98
PTOV1-220ENST00000601675 SYNJ1O43426 1573 aa39.92■■■■□ 3.98
PTOV1-220ENST00000601675 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.9■■■■□ 3.98
PTOV1-220ENST00000601675 SOGA1O94964 1423 aa39.86■■■■□ 3.97
PTOV1-220ENST00000601675 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
PTOV1-220ENST00000601675 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.81■■■■□ 3.96
PTOV1-220ENST00000601675 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
PTOV1-220ENST00000601675 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.63■■■■□ 3.94
PTOV1-220ENST00000601675 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
PTOV1-220ENST00000601675 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.935e-8■■■■■ 29.5
PTOV1-220ENST00000601675 WDR97A6NE52 1622 aa39.56■■■■□ 3.92
PTOV1-220ENST00000601675 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
PTOV1-220ENST00000601675 TRIM41Q8WV44 630 aa39.43■■■■□ 3.9
PTOV1-220ENST00000601675 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.4■■■■□ 3.9
PTOV1-220ENST00000601675 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.38■■■■□ 3.89
PTOV1-220ENST00000601675 GRIN2BQ13224 1484 aa39.33■■■■□ 3.89
PTOV1-220ENST00000601675 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.3■■■■□ 3.88
PTOV1-220ENST00000601675 KIF27Q86VH2 1401 aa39.21■■■■□ 3.87
PTOV1-220ENST00000601675 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
PTOV1-220ENST00000601675 PBRM1Q86U86 1689 aa39.17■■■■□ 3.86
PTOV1-220ENST00000601675 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.17■■■■□ 3.86
PTOV1-220ENST00000601675 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.15■■■■□ 3.86
PTOV1-220ENST00000601675 IGF1RP08069 1367 aa39.08■■■■□ 3.85
PTOV1-220ENST00000601675 SYNJ2O15056 1496 aa39.02■■■■□ 3.84
PTOV1-220ENST00000601675 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
PTOV1-220ENST00000601675 OSCARQ8IYS5 282 aa38.98■■■■□ 3.83
PTOV1-220ENST00000601675 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.97■■■■□ 3.83
PTOV1-220ENST00000601675 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
PTOV1-220ENST00000601675 ADAMTS12P58397 1594 aa38.95■■■■□ 3.83
PTOV1-220ENST00000601675 FBLN2P98095 1184 aa38.94■■■■□ 3.82
PTOV1-220ENST00000601675 CHD1O14646 1710 aa38.9■■■■□ 3.82
PTOV1-220ENST00000601675 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.85■■■■□ 3.81
PTOV1-220ENST00000601675 GRIN2AQ12879 1464 aa38.82■■■■□ 3.8
PTOV1-220ENST00000601675 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
PTOV1-220ENST00000601675 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.81■■■■□ 3.8
PTOV1-220ENST00000601675 EEA1Q15075 1411 aa38.78■■■■□ 3.8
PTOV1-220ENST00000601675 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.69■■■■□ 3.78
PTOV1-220ENST00000601675 NUP160Q12769 1436 aa38.68■■■■□ 3.78
PTOV1-220ENST00000601675 PRXQ9BXM0 1461 aa38.63■■■■□ 3.78
PTOV1-220ENST00000601675 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.6■■■■□ 3.77
PTOV1-220ENST00000601675 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.6■■■■□ 3.77
PTOV1-220ENST00000601675 CEP170Q5SW79 1584 aa38.57■■■■□ 3.77
PTOV1-220ENST00000601675 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
PTOV1-220ENST00000601675 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.41■■■■□ 3.74
PTOV1-220ENST00000601675 JPH4Q96JJ6 628 aa38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms