Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PUS10Q3MIT2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PUS10Q3MIT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS10Q3MIT2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms