RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640939.1

GRAMD1B-217, Transcript of GRAM domain containing 1B, humanhuman

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Gene GRAMD1B, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1B-217ENST00000640939 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.05■■■■■ 6.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.01■■■■■ 5.44
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCC9O60706 1549 aa48.28■■■■■ 5.32
GRAMD1B-217ENST00000640939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.26■■■■■ 5
GRAMD1B-217ENST00000640939 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.19■■■■■ 4.98
GRAMD1B-217ENST00000640939 NACADO15069 1562 aa46.13■■■■■ 4.98
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.72■■■■■ 4.91
GRAMD1B-217ENST00000640939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.47■■■■■ 4.87
GRAMD1B-217ENST00000640939 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.28■■■■■ 4.84
GRAMD1B-217ENST00000640939 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.11■■■■■ 4.81
GRAMD1B-217ENST00000640939 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.91■■■■■ 4.78
GRAMD1B-217ENST00000640939 SCRIBQ14160 1630 aa44.79■■■■■ 4.76
GRAMD1B-217ENST00000640939 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.55■■■■■ 4.72
GRAMD1B-217ENST00000640939 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.3■■■■■ 4.68
GRAMD1B-217ENST00000640939 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
GRAMD1B-217ENST00000640939 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.64■■■■■ 4.58
GRAMD1B-217ENST00000640939 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.38■■■■■ 4.53
GRAMD1B-217ENST00000640939 SMARCA4P51532 1647 aa42.78■■■■■ 4.44
GRAMD1B-217ENST00000640939 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.6■■■■■ 4.41
GRAMD1B-217ENST00000640939 NCAPD3P42695 1498 aa42.58■■■■■ 4.41
GRAMD1B-217ENST00000640939 SMARCA2P51531 1590 aa42.51■■■■■ 4.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.45■■■■■ 4.39
GRAMD1B-217ENST00000640939 HMGXB3Q12766 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
GRAMD1B-217ENST00000640939 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.31■■■■■ 4.36
GRAMD1B-217ENST00000640939 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
GRAMD1B-217ENST00000640939 WIZO95785 1651 aa42.01■■■■■ 4.32
GRAMD1B-217ENST00000640939 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
GRAMD1B-217ENST00000640939 NESP48681 1621 aa41.73■■■■■ 4.27
GRAMD1B-217ENST00000640939 ERCC6Q03468 1493 aa41.6■■■■■ 4.25
GRAMD1B-217ENST00000640939 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.5■■■■■ 4.23
GRAMD1B-217ENST00000640939 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
GRAMD1B-217ENST00000640939 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.34■■■■■ 4.21
GRAMD1B-217ENST00000640939 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.23■■■■■ 4.19
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.21■■■■■ 4.19
GRAMD1B-217ENST00000640939 CUX2O14529 1486 aa41.2■■■■■ 4.19
GRAMD1B-217ENST00000640939 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
GRAMD1B-217ENST00000640939 CFTRP13569 1480 aa41.04■■■■■ 4.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.03■■■■■ 4.16
GRAMD1B-217ENST00000640939 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.89■■■■■ 4.14
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.85■■■■■ 4.13
GRAMD1B-217ENST00000640939 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.84■■■■■ 4.13
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRDM2Q13029 1718 aa40.73■■■■■ 4.11
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR62O43379 1518 aa40.71■■■■■ 4.11
GRAMD1B-217ENST00000640939 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
GRAMD1B-217ENST00000640939 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
GRAMD1B-217ENST00000640939 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.25■■■■■ 4.03
GRAMD1B-217ENST00000640939 TOPBP1Q92547 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
GRAMD1B-217ENST00000640939 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.14■■■■■ 4.02
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCC8Q09428 1581 aa40.13■■■■■ 4.01
GRAMD1B-217ENST00000640939 IFT140Q96RY7 1462 aa39.99■■■■□ 3.99
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GRAMD1B-217ENST00000640939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
GRAMD1B-217ENST00000640939 CUX1P39880 1505 aa39.85■■■■□ 3.97
GRAMD1B-217ENST00000640939 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
GRAMD1B-217ENST00000640939 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.74■■■■□ 3.95
GRAMD1B-217ENST00000640939 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.73■■■■□ 3.95
GRAMD1B-217ENST00000640939 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
GRAMD1B-217ENST00000640939 SOGA1O94964 1423 aa39.69■■■■□ 3.94
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GRAMD1B-217ENST00000640939 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
GRAMD1B-217ENST00000640939 OSCARQ8IYS5 282 aa39.48■■■■□ 3.91
GRAMD1B-217ENST00000640939 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.48■■■■□ 3.91
GRAMD1B-217ENST00000640939 SYNJ1O43426 1573 aa39.42■■■■□ 3.9
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR97A6NE52 1622 aa39.41■■■■□ 3.9
GRAMD1B-217ENST00000640939 TOP2BQ02880 1626 aa39.4■■■■□ 3.9
GRAMD1B-217ENST00000640939 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.4■■■■□ 3.9
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GRAMD1B-217ENST00000640939 CHD1O14646 1710 aa39.28■■■■□ 3.88
GRAMD1B-217ENST00000640939 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.25■■■■□ 3.87
GRAMD1B-217ENST00000640939 GRIN2BQ13224 1484 aa39.24■■■■□ 3.87
GRAMD1B-217ENST00000640939 FBLN2P98095 1184 aa39.23■■■■□ 3.87
GRAMD1B-217ENST00000640939 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.22■■■■□ 3.87
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.19■■■■□ 3.86
GRAMD1B-217ENST00000640939 PBRM1Q86U86 1689 aa39.18■■■■□ 3.86
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GRAMD1B-217ENST00000640939 SYNJ2O15056 1496 aa39.01■■■■□ 3.84
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GRAMD1B-217ENST00000640939 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
GRAMD1B-217ENST00000640939 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
GRAMD1B-217ENST00000640939 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARHGEF11O15085 1522 aa38.85■■■■□ 3.81
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GRAMD1B-217ENST00000640939 GRIN2AQ12879 1464 aa38.74■■■■□ 3.79
GRAMD1B-217ENST00000640939 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.74■■■■□ 3.79
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GRAMD1B-217ENST00000640939 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.54■■■■□ 3.76
GRAMD1B-217ENST00000640939 CUL7Q14999 1698 aa38.43■■■■□ 3.74
GRAMD1B-217ENST00000640939 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.32■■■■□ 3.72
GRAMD1B-217ENST00000640939 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.31■■■■□ 3.72
GRAMD1B-217ENST00000640939 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.31■■■■□ 3.72
GRAMD1B-217ENST00000640939 SHROOM2Q13796 1616 aa38.3■■■■□ 3.72
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