RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379822.5

C15orf59-201, Transcript of UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C15orf59, Length 1,342 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59-201ENST00000379822 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.53■■■■■ 6.64
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C15orf59-201ENST00000379822 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
C15orf59-201ENST00000379822 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.93■■■■■ 5.1
C15orf59-201ENST00000379822 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.69■■■■■ 5.06
C15orf59-201ENST00000379822 NACADO15069 1562 aa46.5■■■■■ 5.04
C15orf59-201ENST00000379822 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.46■■■■■ 5.03
C15orf59-201ENST00000379822 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.25■■■■■ 4.99
C15orf59-201ENST00000379822 SCRIBQ14160 1630 aa45.41■■■■■ 4.86
C15orf59-201ENST00000379822 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.31■■■■■ 4.84
C15orf59-201ENST00000379822 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.16■■■■■ 4.82
C15orf59-201ENST00000379822 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.81■■■■■ 4.76
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C15orf59-201ENST00000379822 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.81■■■■■ 4.6
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C15orf59-201ENST00000379822 SMARCA4P51532 1647 aa43.63■■■■■ 4.58
C15orf59-201ENST00000379822 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.54■■■■■ 4.56
C15orf59-201ENST00000379822 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
C15orf59-201ENST00000379822 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
C15orf59-201ENST00000379822 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.26■■■■■ 4.52
C15orf59-201ENST00000379822 WIZO95785 1651 aa43.16■■■■■ 4.5
C15orf59-201ENST00000379822 SMARCA2P51531 1590 aa43.1■■■■■ 4.49
C15orf59-201ENST00000379822 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
C15orf59-201ENST00000379822 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.03■■■■■ 4.48
C15orf59-201ENST00000379822 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.01■■■■■ 4.48
C15orf59-201ENST00000379822 NCAPD3P42695 1498 aa42.86■■■■■ 4.45
C15orf59-201ENST00000379822 HMGXB3Q12766 1538 aa42.82■■■■■ 4.44
C15orf59-201ENST00000379822 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
C15orf59-201ENST00000379822 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
C15orf59-201ENST00000379822 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.33■■■■■ 4.37
C15orf59-201ENST00000379822 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.23■■■■■ 4.35
C15orf59-201ENST00000379822 CFTRP13569 1480 aa41.68■■■■■ 4.26
C15orf59-201ENST00000379822 PRDM2Q13029 1718 aa41.64■■■■■ 4.26
C15orf59-201ENST00000379822 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.62■■■■■ 4.25
C15orf59-201ENST00000379822 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.59■■■■■ 4.25
C15orf59-201ENST00000379822 NESP48681 1621 aa41.37■■■■■ 4.21
C15orf59-201ENST00000379822 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.17■■■■■ 4.18
C15orf59-201ENST00000379822 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.15■■■■■ 4.18
C15orf59-201ENST00000379822 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.05■■■■■ 4.16
C15orf59-201ENST00000379822 ABCC8Q09428 1581 aa41.04■■■■■ 4.16
C15orf59-201ENST00000379822 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.03■■■■■ 4.16
C15orf59-201ENST00000379822 CEP164Q9UPV0 1460 aa41■■■■■ 4.15
C15orf59-201ENST00000379822 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
C15orf59-201ENST00000379822 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.85■■■■■ 4.13
C15orf59-201ENST00000379822 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.13
C15orf59-201ENST00000379822 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.12
C15orf59-201ENST00000379822 CUX1P39880 1505 aa40.8■■■■■ 4.12
C15orf59-201ENST00000379822 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.75■■■■■ 4.11
C15orf59-201ENST00000379822 ERCC6Q03468 1493 aa40.74■■■■■ 4.11
C15orf59-201ENST00000379822 TRIM41Q8WV44 630 aa40.71■■■■■ 4.11
C15orf59-201ENST00000379822 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.69■■■■■ 4.1
C15orf59-201ENST00000379822 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
C15orf59-201ENST00000379822 TOPBP1Q92547 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
C15orf59-201ENST00000379822 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
C15orf59-201ENST00000379822 WDR62O43379 1518 aa40.56■■■■■ 4.08
C15orf59-201ENST00000379822 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.44■■■■■ 4.06
C15orf59-201ENST00000379822 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
C15orf59-201ENST00000379822 WDR97A6NE52 1622 aa40.2■■■■■ 4.03
C15orf59-201ENST00000379822 SOGA1O94964 1423 aa40.19■■■■■ 4.02
C15orf59-201ENST00000379822 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
C15orf59-201ENST00000379822 CUX2O14529 1486 aa40.18■■■■■ 4.02
C15orf59-201ENST00000379822 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.15■■■■■ 4.02
C15orf59-201ENST00000379822 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.12■■■■■ 4.01
C15orf59-201ENST00000379822 EEA1Q15075 1411 aa40.11■■■■■ 4.01
C15orf59-201ENST00000379822 IFT140Q96RY7 1462 aa40.09■■■■■ 4.01
C15orf59-201ENST00000379822 KIF27Q86VH2 1401 aa40■■■■□ 3.99
C15orf59-201ENST00000379822 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
C15orf59-201ENST00000379822 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.92■■■■□ 3.98
C15orf59-201ENST00000379822 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.78■■■■□ 3.96
C15orf59-201ENST00000379822 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
C15orf59-201ENST00000379822 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
C15orf59-201ENST00000379822 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.75■■■■□ 3.95
C15orf59-201ENST00000379822 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
C15orf59-201ENST00000379822 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
C15orf59-201ENST00000379822 PBRM1Q86U86 1689 aa39.73■■■■□ 3.95
C15orf59-201ENST00000379822 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.73■■■■□ 3.95
C15orf59-201ENST00000379822 IGF1RP08069 1367 aa39.67■■■■□ 3.94
C15orf59-201ENST00000379822 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.66■■■■□ 3.94
C15orf59-201ENST00000379822 CUL7Q14999 1698 aa39.63■■■■□ 3.94
C15orf59-201ENST00000379822 KIF21BO75037 1637 aa39.63■■■■□ 3.93
C15orf59-201ENST00000379822 GRIN2BQ13224 1484 aa39.62■■■■□ 3.93
C15orf59-201ENST00000379822 PRXQ9BXM0 1461 aa39.58■■■■□ 3.93
C15orf59-201ENST00000379822 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.46■■■■□ 3.91
C15orf59-201ENST00000379822 ADAMTS12P58397 1594 aa39.43■■■■□ 3.9
C15orf59-201ENST00000379822 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
C15orf59-201ENST00000379822 GOLGA3Q08378 1498 aa39.42■■■■□ 3.9
C15orf59-201ENST00000379822 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.39■■■■□ 3.9
C15orf59-201ENST00000379822 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.37■■■■□ 3.89
C15orf59-201ENST00000379822 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.36■■■■□ 3.89
C15orf59-201ENST00000379822 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.26■■■■□ 3.88
C15orf59-201ENST00000379822 SYNJ2O15056 1496 aa39.23■■■■□ 3.87
C15orf59-201ENST00000379822 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.14■■■■□ 3.86
C15orf59-201ENST00000379822 GRIN2AQ12879 1464 aa39.12■■■■□ 3.85
C15orf59-201ENST00000379822 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.09■■■■□ 3.85
C15orf59-201ENST00000379822 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
C15orf59-201ENST00000379822 CHD1O14646 1710 aa39.05■■■■□ 3.84
C15orf59-201ENST00000379822 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.04■■■■□ 3.84
C15orf59-201ENST00000379822 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
C15orf59-201ENST00000379822 NUP160Q12769 1436 aa38.92■■■■□ 3.82
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