Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP3Q02447 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SP3Q02447 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SP3Q02447 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP3Q02447 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP3Q02447 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SP3Q02447 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SP3Q02447 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP3Q02447 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP3Q02447 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP3Q02447 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SP3Q02447 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SP3Q02447 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP3Q02447 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP3Q02447 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SP3Q02447 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SP3Q02447 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP3Q02447 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP3Q02447 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP3Q02447 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP3Q02447 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SP3Q02447 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP3Q02447 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP3Q02447 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP3Q02447 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SP3Q02447 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SP3Q02447 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SP3Q02447 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SP3Q02447 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SP3Q02447 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP3Q02447 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP3Q02447 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SP3Q02447 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SP3Q02447 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SP3Q02447 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SP3Q02447 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SP3Q02447 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SP3Q02447 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP3Q02447 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SP3Q02447 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SP3Q02447 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SP3Q02447 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP3Q02447 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP3Q02447 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SP3Q02447 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SP3Q02447 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SP3Q02447 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SP3Q02447 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP3Q02447 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP3Q02447 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SP3Q02447 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SP3Q02447 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SP3Q02447 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP3Q02447 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP3Q02447 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP3Q02447 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP3Q02447 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP3Q02447 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SP3Q02447 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP3Q02447 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP3Q02447 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SP3Q02447 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SP3Q02447 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms