Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PMF1-BGLAPU3KQ54 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMF1-BGLAPU3KQ54 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1-BGLAPU3KQ54 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMF1-BGLAPU3KQ54 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMF1-BGLAPU3KQ54 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMF1-BGLAPU3KQ54 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMF1-BGLAPU3KQ54 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMF1-BGLAPU3KQ54 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMF1-BGLAPU3KQ54 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMF1-BGLAPU3KQ54 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PMF1-BGLAPU3KQ54 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PMF1-BGLAPU3KQ54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PMF1-BGLAPU3KQ54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PMF1-BGLAPU3KQ54 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMF1-BGLAPU3KQ54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMF1-BGLAPU3KQ54 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMF1-BGLAPU3KQ54 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMF1-BGLAPU3KQ54 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PMF1-BGLAPU3KQ54 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMF1-BGLAPU3KQ54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PMF1-BGLAPU3KQ54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms