Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RPS6KL1Q9Y6S9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPS6KL1Q9Y6S9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KL1Q9Y6S9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KL1Q9Y6S9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KL1Q9Y6S9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KL1Q9Y6S9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KL1Q9Y6S9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KL1Q9Y6S9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KL1Q9Y6S9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KL1Q9Y6S9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KL1Q9Y6S9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS6KL1Q9Y6S9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPS6KL1Q9Y6S9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KL1Q9Y6S9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KL1Q9Y6S9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KL1Q9Y6S9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KL1Q9Y6S9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KL1Q9Y6S9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KL1Q9Y6S9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS6KL1Q9Y6S9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KL1Q9Y6S9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KL1Q9Y6S9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KL1Q9Y6S9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KL1Q9Y6S9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KL1Q9Y6S9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KL1Q9Y6S9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KL1Q9Y6S9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KL1Q9Y6S9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPS6KL1Q9Y6S9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6KL1Q9Y6S9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KL1Q9Y6S9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KL1Q9Y6S9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6KL1Q9Y6S9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KL1Q9Y6S9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPS6KL1Q9Y6S9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPS6KL1Q9Y6S9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms