Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC6Q9Y625 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC6Q9Y625 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC6Q9Y625 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPC6Q9Y625 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC6Q9Y625 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC6Q9Y625 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPC6Q9Y625 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPC6Q9Y625 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC6Q9Y625 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC6Q9Y625 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC6Q9Y625 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GPC6Q9Y625 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC6Q9Y625 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC6Q9Y625 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC6Q9Y625 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC6Q9Y625 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC6Q9Y625 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPC6Q9Y625 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPC6Q9Y625 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPC6Q9Y625 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPC6Q9Y625 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GPC6Q9Y625 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GPC6Q9Y625 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC6Q9Y625 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC6Q9Y625 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC6Q9Y625 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC6Q9Y625 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC6Q9Y625 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC6Q9Y625 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC6Q9Y625 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC6Q9Y625 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC6Q9Y625 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC6Q9Y625 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms